Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHD3Q12873 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHD3Q12873 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CHD3Q12873 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHD3Q12873 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHD3Q12873 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHD3Q12873 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHD3Q12873 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHD3Q12873 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHD3Q12873 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHD3Q12873 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHD3Q12873 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHD3Q12873 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHD3Q12873 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHD3Q12873 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHD3Q12873 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHD3Q12873 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CHD3Q12873 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CHD3Q12873 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHD3Q12873 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHD3Q12873 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHD3Q12873 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHD3Q12873 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHD3Q12873 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHD3Q12873 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHD3Q12873 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHD3Q12873 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHD3Q12873 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHD3Q12873 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHD3Q12873 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHD3Q12873 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHD3Q12873 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHD3Q12873 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHD3Q12873 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHD3Q12873 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHD3Q12873 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHD3Q12873 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHD3Q12873 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHD3Q12873 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CHD3Q12873 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHD3Q12873 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHD3Q12873 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHD3Q12873 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHD3Q12873 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHD3Q12873 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHD3Q12873 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHD3Q12873 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHD3Q12873 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CHD3Q12873 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHD3Q12873 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHD3Q12873 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHD3Q12873 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHD3Q12873 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHD3Q12873 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CHD3Q12873 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CHD3Q12873 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CHD3Q12873 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CHD3Q12873 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
CHD3Q12873 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CHD3Q12873 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CHD3Q12873 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
CHD3Q12873 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
CHD3Q12873 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CHD3Q12873 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
CHD3Q12873 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CHD3Q12873 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CHD3Q12873 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CHD3Q12873 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHD3Q12873 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHD3Q12873 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHD3Q12873 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHD3Q12873 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CHD3Q12873 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHD3Q12873 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHD3Q12873 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHD3Q12873 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHD3Q12873 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHD3Q12873 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHD3Q12873 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHD3Q12873 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHD3Q12873 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHD3Q12873 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHD3Q12873 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHD3Q12873 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CHD3Q12873 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHD3Q12873 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHD3Q12873 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHD3Q12873 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHD3Q12873 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHD3Q12873 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHD3Q12873 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHD3Q12873 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHD3Q12873 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHD3Q12873 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHD3Q12873 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHD3Q12873 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHD3Q12873 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHD3Q12873 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHD3Q12873 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHD3Q12873 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
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