Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PUDPQ08623 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PUDPQ08623 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms