Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE4BQ07343 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE4BQ07343 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE4BQ07343 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE4BQ07343 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE4BQ07343 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE4BQ07343 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE4BQ07343 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE4BQ07343 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE4BQ07343 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE4BQ07343 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE4BQ07343 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE4BQ07343 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE4BQ07343 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE4BQ07343 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE4BQ07343 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE4BQ07343 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE4BQ07343 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE4BQ07343 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE4BQ07343 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE4BQ07343 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE4BQ07343 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE4BQ07343 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE4BQ07343 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE4BQ07343 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE4BQ07343 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE4BQ07343 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE4BQ07343 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE4BQ07343 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE4BQ07343 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE4BQ07343 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE4BQ07343 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE4BQ07343 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE4BQ07343 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE4BQ07343 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE4BQ07343 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE4BQ07343 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE4BQ07343 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE4BQ07343 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PDE4BQ07343 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PDE4BQ07343 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PDE4BQ07343 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDE4BQ07343 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDE4BQ07343 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDE4BQ07343 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PDE4BQ07343 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDE4BQ07343 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDE4BQ07343 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDE4BQ07343 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDE4BQ07343 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDE4BQ07343 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDE4BQ07343 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PDE4BQ07343 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDE4BQ07343 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDE4BQ07343 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDE4BQ07343 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDE4BQ07343 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE4BQ07343 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE4BQ07343 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE4BQ07343 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE4BQ07343 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE4BQ07343 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE4BQ07343 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE4BQ07343 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE4BQ07343 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE4BQ07343 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE4BQ07343 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE4BQ07343 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE4BQ07343 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE4BQ07343 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE4BQ07343 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE4BQ07343 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE4BQ07343 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE4BQ07343 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE4BQ07343 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE4BQ07343 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE4BQ07343 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE4BQ07343 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE4BQ07343 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE4BQ07343 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE4BQ07343 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE4BQ07343 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE4BQ07343 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE4BQ07343 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE4BQ07343 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE4BQ07343 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE4BQ07343 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE4BQ07343 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE4BQ07343 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE4BQ07343 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE4BQ07343 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE4BQ07343 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE4BQ07343 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE4BQ07343 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE4BQ07343 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE4BQ07343 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE4BQ07343 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE4BQ07343 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE4BQ07343 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE4BQ07343 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms