Protein–RNA interactions for Protein: Q07065

CKAP4, Cytoskeleton-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP4Q07065 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CKAP4Q07065 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CKAP4Q07065 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CKAP4Q07065 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CKAP4Q07065 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CKAP4Q07065 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CKAP4Q07065 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CKAP4Q07065 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CKAP4Q07065 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CKAP4Q07065 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CKAP4Q07065 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CKAP4Q07065 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CKAP4Q07065 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CKAP4Q07065 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CKAP4Q07065 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CKAP4Q07065 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CKAP4Q07065 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CKAP4Q07065 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CKAP4Q07065 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CKAP4Q07065 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CKAP4Q07065 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CKAP4Q07065 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CKAP4Q07065 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CKAP4Q07065 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CKAP4Q07065 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CKAP4Q07065 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CKAP4Q07065 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CKAP4Q07065 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CKAP4Q07065 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CKAP4Q07065 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CKAP4Q07065 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CKAP4Q07065 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CKAP4Q07065 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CKAP4Q07065 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CKAP4Q07065 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CKAP4Q07065 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CKAP4Q07065 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CKAP4Q07065 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CKAP4Q07065 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CKAP4Q07065 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CKAP4Q07065 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CKAP4Q07065 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CKAP4Q07065 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CKAP4Q07065 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CKAP4Q07065 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CKAP4Q07065 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CKAP4Q07065 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CKAP4Q07065 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CKAP4Q07065 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CKAP4Q07065 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CKAP4Q07065 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CKAP4Q07065 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CKAP4Q07065 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CKAP4Q07065 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CKAP4Q07065 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CKAP4Q07065 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CKAP4Q07065 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CKAP4Q07065 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CKAP4Q07065 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CKAP4Q07065 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CKAP4Q07065 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CKAP4Q07065 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CKAP4Q07065 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CKAP4Q07065 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CKAP4Q07065 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CKAP4Q07065 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CKAP4Q07065 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CKAP4Q07065 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CKAP4Q07065 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CKAP4Q07065 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CKAP4Q07065 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CKAP4Q07065 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CKAP4Q07065 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CKAP4Q07065 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CKAP4Q07065 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CKAP4Q07065 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CKAP4Q07065 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CKAP4Q07065 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CKAP4Q07065 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CKAP4Q07065 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CKAP4Q07065 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CKAP4Q07065 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CKAP4Q07065 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CKAP4Q07065 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CKAP4Q07065 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CKAP4Q07065 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CKAP4Q07065 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CKAP4Q07065 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CKAP4Q07065 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CKAP4Q07065 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CKAP4Q07065 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CKAP4Q07065 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CKAP4Q07065 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CKAP4Q07065 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CKAP4Q07065 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CKAP4Q07065 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CKAP4Q07065 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CKAP4Q07065 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CKAP4Q07065 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CKAP4Q07065 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms