Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms