Protein–RNA interactions for Protein: Q05519

SRSF11, Serine/arginine-rich splicing factor 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF11Q05519 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SRSF11Q05519 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SRSF11Q05519 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SRSF11Q05519 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SRSF11Q05519 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SRSF11Q05519 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SRSF11Q05519 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SRSF11Q05519 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SRSF11Q05519 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SRSF11Q05519 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SRSF11Q05519 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SRSF11Q05519 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SRSF11Q05519 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SRSF11Q05519 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SRSF11Q05519 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SRSF11Q05519 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SRSF11Q05519 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SRSF11Q05519 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SRSF11Q05519 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SRSF11Q05519 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SRSF11Q05519 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SRSF11Q05519 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SRSF11Q05519 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SRSF11Q05519 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SRSF11Q05519 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SRSF11Q05519 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SRSF11Q05519 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms