Protein–RNA interactions for Protein: Q04864

REL, Proto-oncogene c-Rel, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELQ04864 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RELQ04864 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RELQ04864 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RELQ04864 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RELQ04864 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RELQ04864 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RELQ04864 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RELQ04864 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RELQ04864 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RELQ04864 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RELQ04864 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RELQ04864 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RELQ04864 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RELQ04864 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RELQ04864 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RELQ04864 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RELQ04864 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RELQ04864 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RELQ04864 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RELQ04864 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RELQ04864 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RELQ04864 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RELQ04864 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RELQ04864 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RELQ04864 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RELQ04864 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RELQ04864 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RELQ04864 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RELQ04864 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RELQ04864 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RELQ04864 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RELQ04864 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RELQ04864 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RELQ04864 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RELQ04864 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RELQ04864 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RELQ04864 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RELQ04864 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RELQ04864 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RELQ04864 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RELQ04864 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RELQ04864 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RELQ04864 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RELQ04864 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RELQ04864 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RELQ04864 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RELQ04864 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RELQ04864 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RELQ04864 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RELQ04864 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RELQ04864 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RELQ04864 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RELQ04864 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RELQ04864 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RELQ04864 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RELQ04864 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RELQ04864 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RELQ04864 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RELQ04864 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RELQ04864 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RELQ04864 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RELQ04864 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RELQ04864 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RELQ04864 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RELQ04864 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RELQ04864 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RELQ04864 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RELQ04864 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RELQ04864 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RELQ04864 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RELQ04864 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RELQ04864 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RELQ04864 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RELQ04864 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RELQ04864 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RELQ04864 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RELQ04864 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RELQ04864 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RELQ04864 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RELQ04864 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RELQ04864 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RELQ04864 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RELQ04864 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RELQ04864 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RELQ04864 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RELQ04864 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RELQ04864 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RELQ04864 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RELQ04864 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RELQ04864 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RELQ04864 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RELQ04864 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RELQ04864 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RELQ04864 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RELQ04864 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RELQ04864 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RELQ04864 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RELQ04864 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RELQ04864 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RELQ04864 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.2 ms