Protein–RNA interactions for Protein: Q04048

SYF1, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SYF1Q04048 SIP18YMR175W 240 nt2.48□□□□□ -2.01
SYF1Q04048 MGR1YCL044C 1254 nt2.48□□□□□ -2.01
SYF1Q04048 YPR097WYPR097W 3222 nt2.47□□□□□ -2.01
SYF1Q04048 UFD4YKL010C 4452 nt2.47□□□□□ -2.01
SYF1Q04048 FMP16YDR070C 282 nt2.47□□□□□ -2.01
SYF1Q04048 YER038W-AYER038W-A 381 nt2.47□□□□□ -2.01
SYF1Q04048 PRM8YGL053W 714 nt2.47□□□□□ -2.01
SYF1Q04048 PAU8YAL068C 363 nt2.47□□□□□ -2.01
SYF1Q04048 YLR154W-AYLR154W-A 186 nt2.47□□□□□ -2.01
SYF1Q04048 YLR458WYLR458W 381 nt2.47□□□□□ -2.01
SYF1Q04048 PHO80YOL001W 882 nt2.47□□□□□ -2.01
SYF1Q04048 PAU20YOL161C 363 nt2.47□□□□□ -2.01
SYF1Q04048 JID1YPR061C 906 nt2.47□□□□□ -2.01
SYF1Q04048 PEP1YBL017C 4740 nt2.47□□□□□ -2.01
SYF1Q04048 YGR290WYGR290W 444 nt2.46□□□□□ -2.02
SYF1Q04048 PET191YJR034W 327 nt2.46□□□□□ -2.02
SYF1Q04048 YLR456WYLR456W 615 nt2.46□□□□□ -2.02
SYF1Q04048 SAS2YMR127C 1017 nt2.46□□□□□ -2.02
SYF1Q04048 SPF1YEL031W 3648 nt2.46□□□□□ -2.02
SYF1Q04048 YJL070CYJL070C 2667 nt2.45□□□□□ -2.02
SYF1Q04048 PTC5YOR090C 1719 nt2.45□□□□□ -2.02
SYF1Q04048 MSL5YLR116W 1431 nt2.45□□□□□ -2.02
SYF1Q04048 YFR016CYFR016C 3702 nt2.45□□□□□ -2.02
SYF1Q04048 TIM9YEL020W-A 264 nt2.45□□□□□ -2.02
SYF1Q04048 TPM2YIL138C 486 nt2.45□□□□□ -2.02
SYF1Q04048 PEX17YNL214W 600 nt2.45□□□□□ -2.02
SYF1Q04048 SWR1YDR334W 4545 nt2.45□□□□□ -2.02
SYF1Q04048 CSF1YLR087C 8877 nt2.45□□□□□ -2.02
SYF1Q04048 UBP11YKR098C 2154 nt2.44□□□□□ -2.02
SYF1Q04048 YER172C-AYER172C-A 381 nt2.44□□□□□ -2.02
SYF1Q04048 SHE2YKL130C 741 nt2.44□□□□□ -2.02
SYF1Q04048 CMS1YLR003C 876 nt2.44□□□□□ -2.02
SYF1Q04048 YJL181WYJL181W 1836 nt2.44□□□□□ -2.02
SYF1Q04048 DPB11YJL090C 2295 nt2.44□□□□□ -2.02
SYF1Q04048 BRO1YPL084W 2535 nt2.43□□□□□ -2.02
SYF1Q04048 KOG1YHR186C 4674 nt2.43□□□□□ -2.02
SYF1Q04048 RTR2YDR066C 591 nt2.43□□□□□ -2.02
SYF1Q04048 PEP8YJL053W 1140 nt2.43□□□□□ -2.02
SYF1Q04048 YAL059C-AYAL059C-A 423 nt2.43□□□□□ -2.02
SYF1Q04048 RPS17AYML024W 411 nt2.43□□□□□ -2.02
SYF1Q04048 STH1YIL126W 4080 nt2.43□□□□□ -2.02
SYF1Q04048 DNF1YER166W 4716 nt2.42□□□□□ -2.02
SYF1Q04048 SIR4YDR227W 4077 nt2.42□□□□□ -2.02
SYF1Q04048 SNU56YDR240C 1479 nt2.42□□□□□ -2.02
SYF1Q04048 RNR4YGR180C 1038 nt2.42□□□□□ -2.02
SYF1Q04048 RPL40AYIL148W 387 nt2.42□□□□□ -2.02
SYF1Q04048 YNL146C-AYNL146C-A 195 nt2.42□□□□□ -2.02
SYF1Q04048 TOA1YOR194C 861 nt2.42□□□□□ -2.02
SYF1Q04048 SVS1YPL163C 783 nt2.42□□□□□ -2.02
SYF1Q04048 MF(ALPHA)1YPL187W 498 nt2.42□□□□□ -2.02
SYF1Q04048 BRE1YDL074C 2103 nt2.42□□□□□ -2.02
SYF1Q04048 REV1YOR346W 2958 nt2.42□□□□□ -2.02
SYF1Q04048 AHC2YCR082W 387 nt2.41□□□□□ -2.02
SYF1Q04048 TIM10YHR005C-A 282 nt2.41□□□□□ -2.02
SYF1Q04048 VPS20YMR077C 666 nt2.41□□□□□ -2.02
SYF1Q04048 VTI1YMR197C 654 nt2.41□□□□□ -2.02
SYF1Q04048 RPB11YOL005C 363 nt2.41□□□□□ -2.02
SYF1Q04048 ATX2YOR079C 942 nt2.41□□□□□ -2.02
SYF1Q04048 YOR105WYOR105W 327 nt2.41□□□□□ -2.02
SYF1Q04048 GAL7YBR018C 1101 nt2.41□□□□□ -2.02
SYF1Q04048 DAD3YBR233W-A 285 nt2.41□□□□□ -2.02
SYF1Q04048 FAB1YFR019W 6837 nt2.41□□□□□ -2.02
SYF1Q04048 SNX41YDR425W 1878 nt2.41□□□□□ -2.02
SYF1Q04048 MDM32YOR147W 1869 nt2.41□□□□□ -2.02
SYF1Q04048 TAE2YPL009C 3117 nt2.41□□□□□ -2.02
SYF1Q04048 RRP6YOR001W 2202 nt2.41□□□□□ -2.02
SYF1Q04048 NCL1YBL024W 2055 nt2.4□□□□□ -2.02
SYF1Q04048 TOR1YJR066W 7413 nt2.4□□□□□ -2.02
SYF1Q04048 NAN1YPL126W 2691 nt2.4□□□□□ -2.02
SYF1Q04048 YJR098CYJR098C 1971 nt2.4□□□□□ -2.02
SYF1Q04048 IRC4YDR540C 540 nt2.4□□□□□ -2.03
SYF1Q04048 YKR051WYKR051W 1257 nt2.4□□□□□ -2.03
SYF1Q04048 YNL122CYNL122C 348 nt2.4□□□□□ -2.03
SYF1Q04048 PHR1YOR386W 1698 nt2.4□□□□□ -2.03
SYF1Q04048 SHE9YDR393W 1371 nt2.39□□□□□ -2.03
SYF1Q04048 YGL014C-AYGL014C-A 162 nt2.39□□□□□ -2.03
SYF1Q04048 RPL16AYIL133C 600 nt2.39□□□□□ -2.03
SYF1Q04048 SPC1YJR010C-A 285 nt2.39□□□□□ -2.03
SYF1Q04048 ARP7YPR034W 1434 nt2.39□□□□□ -2.03
SYF1Q04048 MET18YIL128W 3099 nt2.39□□□□□ -2.03
SYF1Q04048 SAP185YJL098W 3177 nt2.38□□□□□ -2.03
SYF1Q04048 RPL9AYGL147C 576 nt2.38□□□□□ -2.03
SYF1Q04048 MSL1YIR009W 336 nt2.38□□□□□ -2.03
SYF1Q04048 RPL37AYLR185W 267 nt2.38□□□□□ -2.03
SYF1Q04048 URA10YMR271C 684 nt2.38□□□□□ -2.03
SYF1Q04048 PET123YOR158W 957 nt2.38□□□□□ -2.03
SYF1Q04048 TOF1YNL273W 3717 nt2.38□□□□□ -2.03
SYF1Q04048 RRP12YPL012W 3687 nt2.38□□□□□ -2.03
SYF1Q04048 BNI1YNL271C 5862 nt2.37□□□□□ -2.03
SYF1Q04048 SPE1YKL184W 1401 nt2.37□□□□□ -2.03
SYF1Q04048 MXR1YER042W 555 nt2.37□□□□□ -2.03
SYF1Q04048 YKL044WYKL044W 321 nt2.37□□□□□ -2.03
SYF1Q04048 AFI1YOR129C 2682 nt2.36□□□□□ -2.03
SYF1Q04048 CDC53YDL132W 2448 nt2.36□□□□□ -2.03
SYF1Q04048 YDL025W-AYDL025W-A 105 nt2.36□□□□□ -2.03
SYF1Q04048 YDR220CYDR220C 294 nt2.36□□□□□ -2.03
SYF1Q04048 LSM7YNL147W 348 nt2.36□□□□□ -2.03
SYF1Q04048 IRC20YLR247C 4671 nt2.36□□□□□ -2.03
SYF1Q04048 UBR1YGR184C 5853 nt2.36□□□□□ -2.03
SYF1Q04048 RAV1YJR033C 4074 nt2.36□□□□□ -2.03
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