Protein–RNA interactions for Protein: Q03790

NUP53, Nucleoporin NUP53, yeastyeast

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Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NUP53Q03790 HEH2YDR458C 1992 nt2.63□□□□□ -1.99
NUP53Q03790 SNX41YDR425W 1878 nt2.62□□□□□ -1.99
NUP53Q03790 SLP1YOR154W 1764 nt2.62□□□□□ -1.99
NUP53Q03790 RPL30YGL030W 318 nt2.62□□□□□ -1.99
NUP53Q03790 YPL152W-AYPL152W-A 99 nt2.62□□□□□ -1.99
NUP53Q03790 TAF2YCR042C 4224 nt2.62□□□□□ -1.99
NUP53Q03790 NDD1YOR372C 1665 nt2.62□□□□□ -1.99
NUP53Q03790 DSE4YNR067C 3354 nt2.62□□□□□ -1.99
NUP53Q03790 ALY1YKR021W 2748 nt2.62□□□□□ -1.99
NUP53Q03790 ORC1YML065W 2745 nt2.61□□□□□ -1.99
NUP53Q03790 DYN2YDR424C 279 nt2.61□□□□□ -1.99
NUP53Q03790 PAU14YIL176C 363 nt2.61□□□□□ -1.99
NUP53Q03790 PAU1YJL223C 363 nt2.61□□□□□ -1.99
NUP53Q03790 PUF6YDR496C 1971 nt2.61□□□□□ -1.99
NUP53Q03790 MES1YGR264C 2256 nt2.61□□□□□ -1.99
NUP53Q03790 CCT7YJL111W 1653 nt2.6□□□□□ -1.99
NUP53Q03790 RGR1YLR071C 3249 nt2.6□□□□□ -1.99
NUP53Q03790 IRC4YDR540C 540 nt2.6□□□□□ -1.99
NUP53Q03790 RPL29YFR032C-A 180 nt2.6□□□□□ -1.99
NUP53Q03790 YGL007C-AYGL007C-A 87 nt2.6□□□□□ -1.99
NUP53Q03790 YJR023CYJR023C 402 nt2.6□□□□□ -1.99
NUP53Q03790 HEM4YOR278W 828 nt2.6□□□□□ -1.99
NUP53Q03790 YPL238CYPL238C 390 nt2.6□□□□□ -1.99
NUP53Q03790 NMA111YNL123W 2994 nt2.6□□□□□ -1.99
NUP53Q03790 PSK1YAL017W 4071 nt2.59□□□□□ -1.99
NUP53Q03790 ATP17YDR377W 306 nt2.59□□□□□ -1.99
NUP53Q03790 YER188C-AYER188C-A 300 nt2.59□□□□□ -1.99
NUP53Q03790 RPL39YJL189W 156 nt2.59□□□□□ -1.99
NUP53Q03790 DPB11YJL090C 2295 nt2.59□□□□□ -1.99
NUP53Q03790 ILS1YBL076C 3219 nt2.58□□□□□ -2
NUP53Q03790 YHR078WYHR078W 1659 nt2.58□□□□□ -2
NUP53Q03790 APC11YDL008W 498 nt2.58□□□□□ -2
NUP53Q03790 YER076W-AYER076W-A 348 nt2.58□□□□□ -2
NUP53Q03790 AST2YER101C 1293 nt2.58□□□□□ -2
NUP53Q03790 YFR056CYFR056C 369 nt2.58□□□□□ -2
NUP53Q03790 ERP6YGL002W 651 nt2.58□□□□□ -2
NUP53Q03790 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt2.58□□□□□ -2
NUP53Q03790 SLM6YBR266C 453 nt2.58□□□□□ -2
NUP53Q03790 PSY2YNL201C 2577 nt2.58□□□□□ -2
NUP53Q03790 SNF12YNR023W 1701 nt2.58□□□□□ -2
NUP53Q03790 CSR2YPR030W 3366 nt2.58□□□□□ -2
NUP53Q03790 YBP1YBR216C 2025 nt2.58□□□□□ -2
NUP53Q03790 ITC1YGL133W 3795 nt2.57□□□□□ -2
NUP53Q03790 CYC7YEL039C 342 nt2.57□□□□□ -2
NUP53Q03790 YFL063WYFL063W 456 nt2.57□□□□□ -2
NUP53Q03790 URM1YIL008W 300 nt2.57□□□□□ -2
NUP53Q03790 YJL015CYJL015C 285 nt2.57□□□□□ -2
NUP53Q03790 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt2.57□□□□□ -2
NUP53Q03790 YKL111CYKL111C 336 nt2.57□□□□□ -2
NUP53Q03790 JIP3YLR331C 378 nt2.57□□□□□ -2
NUP53Q03790 RPS22BYLR367W 393 nt2.57□□□□□ -2
NUP53Q03790 RPL20AYMR242C 519 nt2.57□□□□□ -2
NUP53Q03790 RPB11YOL005C 363 nt2.57□□□□□ -2
NUP53Q03790 IRC23YOR044W 474 nt2.57□□□□□ -2
NUP53Q03790 KAP104YBR017C 2757 nt2.57□□□□□ -2
NUP53Q03790 YOL057WYOL057W 2136 nt2.57□□□□□ -2
NUP53Q03790 TAO3YIL129C 7131 nt2.57□□□□□ -2
NUP53Q03790 KIN82YCR091W 2163 nt2.57□□□□□ -2
NUP53Q03790 NOT5YPR072W 1683 nt2.57□□□□□ -2
NUP53Q03790 VPS64YDR200C 1815 nt2.56□□□□□ -2
NUP53Q03790 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt2.56□□□□□ -2
NUP53Q03790 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt2.56□□□□□ -2
NUP53Q03790 FCF2YLR051C 654 nt2.56□□□□□ -2
NUP53Q03790 RPL37AYLR185W 267 nt2.56□□□□□ -2
NUP53Q03790 YPR014CYPR014C 330 nt2.56□□□□□ -2
NUP53Q03790 YLR001CYLR001C 2589 nt2.56□□□□□ -2
NUP53Q03790 CYR1YJL005W 6081 nt2.56□□□□□ -2
NUP53Q03790 YER107W-AYER107W-A 321 nt2.55□□□□□ -2
NUP53Q03790 PMR1YGL167C 2853 nt2.55□□□□□ -2
NUP53Q03790 TRZ1YKR079C 2517 nt2.55□□□□□ -2
NUP53Q03790 RPL26AYLR344W 384 nt2.55□□□□□ -2
NUP53Q03790 CHS2YBR038W 2892 nt2.55□□□□□ -2
NUP53Q03790 FRE2YKL220C 2136 nt2.54□□□□□ -2
NUP53Q03790 MDM32YOR147W 1869 nt2.54□□□□□ -2
NUP53Q03790 ERG28YER044C 447 nt2.54□□□□□ -2
NUP53Q03790 TIM8YJR135W-A 264 nt2.54□□□□□ -2
NUP53Q03790 YML037CYML037C 1023 nt2.54□□□□□ -2
NUP53Q03790 YBL073WYBL073W 312 nt2.54□□□□□ -2
NUP53Q03790 YPL229WYPL229W 621 nt2.54□□□□□ -2
NUP53Q03790 ATP15YPL271W 189 nt2.54□□□□□ -2
NUP53Q03790 BUB1YGR188C 3066 nt2.54□□□□□ -2
NUP53Q03790 YOR296WYOR296W 3870 nt2.53□□□□□ -2
NUP53Q03790 YIL169CYIL169C 2988 nt2.53□□□□□ -2
NUP53Q03790 LYS9YNR050C 1341 nt2.53□□□□□ -2
NUP53Q03790 TIM11YDR322C-A 291 nt2.53□□□□□ -2
NUP53Q03790 Q0092Q0092 141 nt2.53□□□□□ -2
NUP53Q03790 YER023C-AYER023C-A 213 nt2.53□□□□□ -2
NUP53Q03790 YGR069WYGR069W 336 nt2.53□□□□□ -2
NUP53Q03790 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.53□□□□□ -2
NUP53Q03790 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.53□□□□□ -2
NUP53Q03790 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.53□□□□□ -2
NUP53Q03790 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.53□□□□□ -2
NUP53Q03790 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.53□□□□□ -2
NUP53Q03790 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.53□□□□□ -2
NUP53Q03790 PHD1YKL043W 1101 nt2.53□□□□□ -2
NUP53Q03790 YPR099CYPR099C 357 nt2.53□□□□□ -2
NUP53Q03790 snR191snR191 274 nt2.53□□□□□ -2
NUP53Q03790 PCF11YDR228C 1881 nt2.53□□□□□ -2
NUP53Q03790 MET6YER091C 2304 nt2.53□□□□□ -2
NUP53Q03790 RSN1YMR266W 2862 nt2.53□□□□□ -2
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