Protein–RNA interactions for Protein: Q02535

ID3, DNA-binding protein inhibitor ID-3, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID3Q02535 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ID3Q02535 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ID3Q02535 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ID3Q02535 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ID3Q02535 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ID3Q02535 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ID3Q02535 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ID3Q02535 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ID3Q02535 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ID3Q02535 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ID3Q02535 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ID3Q02535 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ID3Q02535 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ID3Q02535 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ID3Q02535 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ID3Q02535 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ID3Q02535 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ID3Q02535 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ID3Q02535 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ID3Q02535 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ID3Q02535 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ID3Q02535 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ID3Q02535 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ID3Q02535 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ID3Q02535 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ID3Q02535 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ID3Q02535 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ID3Q02535 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ID3Q02535 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ID3Q02535 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ID3Q02535 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ID3Q02535 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ID3Q02535 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ID3Q02535 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ID3Q02535 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ID3Q02535 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ID3Q02535 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ID3Q02535 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ID3Q02535 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ID3Q02535 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ID3Q02535 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ID3Q02535 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ID3Q02535 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ID3Q02535 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ID3Q02535 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ID3Q02535 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ID3Q02535 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ID3Q02535 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ID3Q02535 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ID3Q02535 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ID3Q02535 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ID3Q02535 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ID3Q02535 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ID3Q02535 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ID3Q02535 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ID3Q02535 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ID3Q02535 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ID3Q02535 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ID3Q02535 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ID3Q02535 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ID3Q02535 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ID3Q02535 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ID3Q02535 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ID3Q02535 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ID3Q02535 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ID3Q02535 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ID3Q02535 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ID3Q02535 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ID3Q02535 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ID3Q02535 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ID3Q02535 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ID3Q02535 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ID3Q02535 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ID3Q02535 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ID3Q02535 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ID3Q02535 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ID3Q02535 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ID3Q02535 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ID3Q02535 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ID3Q02535 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ID3Q02535 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ID3Q02535 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ID3Q02535 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ID3Q02535 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ID3Q02535 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ID3Q02535 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ID3Q02535 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ID3Q02535 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ID3Q02535 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ID3Q02535 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ID3Q02535 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ID3Q02535 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ID3Q02535 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ID3Q02535 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ID3Q02535 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ID3Q02535 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ID3Q02535 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ID3Q02535 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ID3Q02535 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ID3Q02535 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms