Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
OTUD4Q01804 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms