Protein–RNA interactions for Protein: Q00341

HDLBP, Vigilin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBPQ00341 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HDLBPQ00341 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HDLBPQ00341 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HDLBPQ00341 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HDLBPQ00341 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HDLBPQ00341 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HDLBPQ00341 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HDLBPQ00341 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HDLBPQ00341 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HDLBPQ00341 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HDLBPQ00341 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HDLBPQ00341 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HDLBPQ00341 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HDLBPQ00341 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDLBPQ00341 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDLBPQ00341 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDLBPQ00341 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDLBPQ00341 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDLBPQ00341 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDLBPQ00341 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDLBPQ00341 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDLBPQ00341 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDLBPQ00341 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDLBPQ00341 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HDLBPQ00341 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDLBPQ00341 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDLBPQ00341 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDLBPQ00341 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDLBPQ00341 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDLBPQ00341 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDLBPQ00341 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDLBPQ00341 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDLBPQ00341 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDLBPQ00341 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDLBPQ00341 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
HDLBPQ00341 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
HDLBPQ00341 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDLBPQ00341 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDLBPQ00341 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
HDLBPQ00341 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDLBPQ00341 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDLBPQ00341 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDLBPQ00341 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDLBPQ00341 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDLBPQ00341 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDLBPQ00341 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDLBPQ00341 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDLBPQ00341 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDLBPQ00341 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDLBPQ00341 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDLBPQ00341 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDLBPQ00341 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDLBPQ00341 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDLBPQ00341 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDLBPQ00341 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDLBPQ00341 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDLBPQ00341 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HDLBPQ00341 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDLBPQ00341 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDLBPQ00341 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDLBPQ00341 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDLBPQ00341 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDLBPQ00341 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDLBPQ00341 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
HDLBPQ00341 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDLBPQ00341 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
HDLBPQ00341 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDLBPQ00341 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDLBPQ00341 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDLBPQ00341 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDLBPQ00341 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDLBPQ00341 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDLBPQ00341 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDLBPQ00341 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDLBPQ00341 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDLBPQ00341 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDLBPQ00341 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDLBPQ00341 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDLBPQ00341 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDLBPQ00341 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDLBPQ00341 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDLBPQ00341 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
HDLBPQ00341 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDLBPQ00341 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDLBPQ00341 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDLBPQ00341 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HDLBPQ00341 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HDLBPQ00341 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HDLBPQ00341 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HDLBPQ00341 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms