Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EFNB1P98172 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNB1P98172 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms