Protein–RNA interactions for Protein: P86452

ZBED6, Zinc finger BED domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED6P86452 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZBED6P86452 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZBED6P86452 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZBED6P86452 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZBED6P86452 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZBED6P86452 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZBED6P86452 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZBED6P86452 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZBED6P86452 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZBED6P86452 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZBED6P86452 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZBED6P86452 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZBED6P86452 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZBED6P86452 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZBED6P86452 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZBED6P86452 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZBED6P86452 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZBED6P86452 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZBED6P86452 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZBED6P86452 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZBED6P86452 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ZBED6P86452 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ZBED6P86452 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZBED6P86452 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZBED6P86452 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZBED6P86452 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZBED6P86452 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZBED6P86452 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZBED6P86452 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZBED6P86452 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZBED6P86452 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZBED6P86452 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZBED6P86452 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZBED6P86452 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZBED6P86452 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ZBED6P86452 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZBED6P86452 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZBED6P86452 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZBED6P86452 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZBED6P86452 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZBED6P86452 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZBED6P86452 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZBED6P86452 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZBED6P86452 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZBED6P86452 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZBED6P86452 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZBED6P86452 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZBED6P86452 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZBED6P86452 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZBED6P86452 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZBED6P86452 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZBED6P86452 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ZBED6P86452 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ZBED6P86452 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ZBED6P86452 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZBED6P86452 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZBED6P86452 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZBED6P86452 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZBED6P86452 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZBED6P86452 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZBED6P86452 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZBED6P86452 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZBED6P86452 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZBED6P86452 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZBED6P86452 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZBED6P86452 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZBED6P86452 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZBED6P86452 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZBED6P86452 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZBED6P86452 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZBED6P86452 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZBED6P86452 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZBED6P86452 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZBED6P86452 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZBED6P86452 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZBED6P86452 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZBED6P86452 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZBED6P86452 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZBED6P86452 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZBED6P86452 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZBED6P86452 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZBED6P86452 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZBED6P86452 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZBED6P86452 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZBED6P86452 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZBED6P86452 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZBED6P86452 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZBED6P86452 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZBED6P86452 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZBED6P86452 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZBED6P86452 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZBED6P86452 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZBED6P86452 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ZBED6P86452 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZBED6P86452 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZBED6P86452 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZBED6P86452 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZBED6P86452 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZBED6P86452 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZBED6P86452 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms