Protein–RNA interactions for Protein: P84103

SRSF3, Serine/arginine-rich splicing factor 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF3P84103 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF3P84103 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF3P84103 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF3P84103 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF3P84103 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF3P84103 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF3P84103 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF3P84103 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF3P84103 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF3P84103 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF3P84103 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF3P84103 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF3P84103 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF3P84103 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF3P84103 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF3P84103 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF3P84103 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF3P84103 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF3P84103 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF3P84103 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF3P84103 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF3P84103 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF3P84103 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF3P84103 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF3P84103 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF3P84103 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF3P84103 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF3P84103 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF3P84103 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF3P84103 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF3P84103 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF3P84103 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF3P84103 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF3P84103 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF3P84103 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF3P84103 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF3P84103 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF3P84103 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF3P84103 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF3P84103 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF3P84103 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF3P84103 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF3P84103 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF3P84103 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF3P84103 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF3P84103 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF3P84103 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF3P84103 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF3P84103 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF3P84103 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF3P84103 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF3P84103 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF3P84103 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF3P84103 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF3P84103 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF3P84103 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF3P84103 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF3P84103 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF3P84103 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF3P84103 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF3P84103 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF3P84103 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF3P84103 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF3P84103 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF3P84103 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF3P84103 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF3P84103 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF3P84103 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF3P84103 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF3P84103 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF3P84103 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF3P84103 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF3P84103 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF3P84103 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF3P84103 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF3P84103 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF3P84103 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF3P84103 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF3P84103 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF3P84103 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF3P84103 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF3P84103 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF3P84103 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF3P84103 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF3P84103 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF3P84103 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF3P84103 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF3P84103 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF3P84103 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRSF3P84103 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF3P84103 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF3P84103 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF3P84103 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF3P84103 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF3P84103 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF3P84103 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF3P84103 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF3P84103 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF3P84103 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRSF3P84103 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms