Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HTRA4P83105 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HTRA4P83105 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HTRA4P83105 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HTRA4P83105 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HTRA4P83105 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HTRA4P83105 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HTRA4P83105 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
HTRA4P83105 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HTRA4P83105 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
HTRA4P83105 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HTRA4P83105 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HTRA4P83105 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HTRA4P83105 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HTRA4P83105 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HTRA4P83105 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HTRA4P83105 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HTRA4P83105 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HTRA4P83105 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HTRA4P83105 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HTRA4P83105 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HTRA4P83105 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HTRA4P83105 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HTRA4P83105 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HTRA4P83105 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HTRA4P83105 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HTRA4P83105 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HTRA4P83105 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HTRA4P83105 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HTRA4P83105 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HTRA4P83105 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HTRA4P83105 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HTRA4P83105 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HTRA4P83105 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HTRA4P83105 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HTRA4P83105 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HTRA4P83105 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HTRA4P83105 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HTRA4P83105 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HTRA4P83105 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HTRA4P83105 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HTRA4P83105 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HTRA4P83105 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HTRA4P83105 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HTRA4P83105 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HTRA4P83105 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HTRA4P83105 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HTRA4P83105 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HTRA4P83105 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HTRA4P83105 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HTRA4P83105 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HTRA4P83105 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HTRA4P83105 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HTRA4P83105 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HTRA4P83105 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HTRA4P83105 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HTRA4P83105 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HTRA4P83105 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HTRA4P83105 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HTRA4P83105 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HTRA4P83105 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HTRA4P83105 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HTRA4P83105 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HTRA4P83105 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HTRA4P83105 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HTRA4P83105 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HTRA4P83105 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HTRA4P83105 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HTRA4P83105 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HTRA4P83105 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HTRA4P83105 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HTRA4P83105 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HTRA4P83105 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HTRA4P83105 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HTRA4P83105 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HTRA4P83105 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HTRA4P83105 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HTRA4P83105 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HTRA4P83105 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HTRA4P83105 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HTRA4P83105 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HTRA4P83105 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HTRA4P83105 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HTRA4P83105 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HTRA4P83105 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HTRA4P83105 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HTRA4P83105 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HTRA4P83105 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HTRA4P83105 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HTRA4P83105 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HTRA4P83105 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HTRA4P83105 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HTRA4P83105 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HTRA4P83105 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HTRA4P83105 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HTRA4P83105 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HTRA4P83105 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HTRA4P83105 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HTRA4P83105 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HTRA4P83105 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms