Protein–RNA interactions for Protein: P59074

CHMP4BP1, Putative charged multivesicular body protein 4B-like protein CHMP4BP1, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4BP1P59074 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMP4BP1P59074 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMP4BP1P59074 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMP4BP1P59074 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMP4BP1P59074 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMP4BP1P59074 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMP4BP1P59074 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMP4BP1P59074 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMP4BP1P59074 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMP4BP1P59074 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMP4BP1P59074 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMP4BP1P59074 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMP4BP1P59074 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHMP4BP1P59074 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHMP4BP1P59074 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHMP4BP1P59074 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHMP4BP1P59074 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHMP4BP1P59074 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHMP4BP1P59074 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHMP4BP1P59074 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHMP4BP1P59074 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHMP4BP1P59074 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMP4BP1P59074 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMP4BP1P59074 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMP4BP1P59074 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMP4BP1P59074 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMP4BP1P59074 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMP4BP1P59074 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMP4BP1P59074 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMP4BP1P59074 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMP4BP1P59074 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMP4BP1P59074 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMP4BP1P59074 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMP4BP1P59074 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMP4BP1P59074 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMP4BP1P59074 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMP4BP1P59074 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMP4BP1P59074 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMP4BP1P59074 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHMP4BP1P59074 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHMP4BP1P59074 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHMP4BP1P59074 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHMP4BP1P59074 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHMP4BP1P59074 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHMP4BP1P59074 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHMP4BP1P59074 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHMP4BP1P59074 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHMP4BP1P59074 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHMP4BP1P59074 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHMP4BP1P59074 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHMP4BP1P59074 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHMP4BP1P59074 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHMP4BP1P59074 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHMP4BP1P59074 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHMP4BP1P59074 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHMP4BP1P59074 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHMP4BP1P59074 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHMP4BP1P59074 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHMP4BP1P59074 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHMP4BP1P59074 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHMP4BP1P59074 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHMP4BP1P59074 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHMP4BP1P59074 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHMP4BP1P59074 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHMP4BP1P59074 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHMP4BP1P59074 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHMP4BP1P59074 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHMP4BP1P59074 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHMP4BP1P59074 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHMP4BP1P59074 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP4BP1P59074 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms