Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
LOXL3P58215 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms