Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLF3P57682 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLF3P57682 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLF3P57682 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLF3P57682 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLF3P57682 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLF3P57682 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
KLF3P57682 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLF3P57682 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLF3P57682 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLF3P57682 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLF3P57682 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLF3P57682 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLF3P57682 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLF3P57682 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLF3P57682 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLF3P57682 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLF3P57682 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLF3P57682 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLF3P57682 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLF3P57682 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLF3P57682 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLF3P57682 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLF3P57682 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLF3P57682 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLF3P57682 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLF3P57682 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLF3P57682 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
KLF3P57682 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
KLF3P57682 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLF3P57682 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLF3P57682 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLF3P57682 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLF3P57682 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KLF3P57682 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KLF3P57682 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KLF3P57682 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KLF3P57682 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KLF3P57682 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KLF3P57682 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLF3P57682 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLF3P57682 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLF3P57682 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLF3P57682 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLF3P57682 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLF3P57682 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLF3P57682 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLF3P57682 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLF3P57682 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLF3P57682 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLF3P57682 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLF3P57682 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLF3P57682 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLF3P57682 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLF3P57682 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLF3P57682 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLF3P57682 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLF3P57682 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLF3P57682 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLF3P57682 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLF3P57682 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLF3P57682 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLF3P57682 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
KLF3P57682 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLF3P57682 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
KLF3P57682 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
KLF3P57682 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLF3P57682 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLF3P57682 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLF3P57682 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLF3P57682 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLF3P57682 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLF3P57682 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLF3P57682 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLF3P57682 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLF3P57682 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLF3P57682 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLF3P57682 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLF3P57682 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
KLF3P57682 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLF3P57682 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
KLF3P57682 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLF3P57682 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLF3P57682 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLF3P57682 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLF3P57682 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLF3P57682 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLF3P57682 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLF3P57682 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLF3P57682 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLF3P57682 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLF3P57682 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLF3P57682 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLF3P57682 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLF3P57682 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLF3P57682 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLF3P57682 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLF3P57682 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLF3P57682 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLF3P57682 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms