Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
GSCP56915 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GSCP56915 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GSCP56915 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GSCP56915 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GSCP56915 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GSCP56915 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GSCP56915 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GSCP56915 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GSCP56915 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GSCP56915 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GSCP56915 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GSCP56915 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GSCP56915 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GSCP56915 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GSCP56915 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GSCP56915 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GSCP56915 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GSCP56915 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GSCP56915 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GSCP56915 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GSCP56915 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GSCP56915 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GSCP56915 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GSCP56915 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GSCP56915 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GSCP56915 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GSCP56915 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GSCP56915 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GSCP56915 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GSCP56915 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GSCP56915 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GSCP56915 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GSCP56915 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GSCP56915 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GSCP56915 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GSCP56915 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GSCP56915 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GSCP56915 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GSCP56915 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GSCP56915 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GSCP56915 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GSCP56915 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GSCP56915 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GSCP56915 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GSCP56915 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GSCP56915 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GSCP56915 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GSCP56915 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GSCP56915 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GSCP56915 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GSCP56915 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GSCP56915 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GSCP56915 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GSCP56915 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GSCP56915 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GSCP56915 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GSCP56915 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GSCP56915 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GSCP56915 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GSCP56915 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GSCP56915 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GSCP56915 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GSCP56915 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GSCP56915 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GSCP56915 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GSCP56915 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GSCP56915 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GSCP56915 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GSCP56915 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GSCP56915 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GSCP56915 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GSCP56915 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GSCP56915 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GSCP56915 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GSCP56915 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GSCP56915 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GSCP56915 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GSCP56915 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GSCP56915 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GSCP56915 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GSCP56915 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GSCP56915 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GSCP56915 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GSCP56915 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GSCP56915 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GSCP56915 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GSCP56915 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GSCP56915 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GSCP56915 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GSCP56915 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GSCP56915 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GSCP56915 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GSCP56915 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GSCP56915 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GSCP56915 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GSCP56915 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GSCP56915 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GSCP56915 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GSCP56915 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms