Protein–RNA interactions for Protein: P55058

PLTP, Phospholipid transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLTPP55058 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PLTPP55058 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PLTPP55058 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PLTPP55058 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PLTPP55058 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PLTPP55058 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PLTPP55058 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PLTPP55058 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PLTPP55058 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PLTPP55058 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PLTPP55058 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PLTPP55058 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PLTPP55058 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PLTPP55058 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PLTPP55058 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PLTPP55058 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PLTPP55058 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PLTPP55058 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PLTPP55058 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PLTPP55058 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PLTPP55058 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
PLTPP55058 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PLTPP55058 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PLTPP55058 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PLTPP55058 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PLTPP55058 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PLTPP55058 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PLTPP55058 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PLTPP55058 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PLTPP55058 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PLTPP55058 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PLTPP55058 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PLTPP55058 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PLTPP55058 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PLTPP55058 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PLTPP55058 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PLTPP55058 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PLTPP55058 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PLTPP55058 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PLTPP55058 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PLTPP55058 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PLTPP55058 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PLTPP55058 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PLTPP55058 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PLTPP55058 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PLTPP55058 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PLTPP55058 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PLTPP55058 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PLTPP55058 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PLTPP55058 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PLTPP55058 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PLTPP55058 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
PLTPP55058 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PLTPP55058 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
PLTPP55058 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
PLTPP55058 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PLTPP55058 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PLTPP55058 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PLTPP55058 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PLTPP55058 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PLTPP55058 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PLTPP55058 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PLTPP55058 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PLTPP55058 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PLTPP55058 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PLTPP55058 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PLTPP55058 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PLTPP55058 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PLTPP55058 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PLTPP55058 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PLTPP55058 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PLTPP55058 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PLTPP55058 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PLTPP55058 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PLTPP55058 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PLTPP55058 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PLTPP55058 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PLTPP55058 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PLTPP55058 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PLTPP55058 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PLTPP55058 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PLTPP55058 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PLTPP55058 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PLTPP55058 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PLTPP55058 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PLTPP55058 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PLTPP55058 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PLTPP55058 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PLTPP55058 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PLTPP55058 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PLTPP55058 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PLTPP55058 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PLTPP55058 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PLTPP55058 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PLTPP55058 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PLTPP55058 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PLTPP55058 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PLTPP55058 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PLTPP55058 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PLTPP55058 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms