Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAD23AP54725 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAD23AP54725 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms