Protein–RNA interactions for Protein: P49450

CENPA, Histone H3-like centromeric protein A, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPAP49450 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPAP49450 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPAP49450 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPAP49450 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPAP49450 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPAP49450 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPAP49450 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPAP49450 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPAP49450 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPAP49450 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPAP49450 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPAP49450 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPAP49450 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPAP49450 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPAP49450 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPAP49450 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPAP49450 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPAP49450 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPAP49450 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPAP49450 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPAP49450 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPAP49450 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPAP49450 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPAP49450 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPAP49450 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPAP49450 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPAP49450 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPAP49450 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPAP49450 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPAP49450 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPAP49450 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPAP49450 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPAP49450 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPAP49450 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPAP49450 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPAP49450 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPAP49450 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPAP49450 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPAP49450 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPAP49450 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPAP49450 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPAP49450 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPAP49450 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPAP49450 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPAP49450 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPAP49450 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPAP49450 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPAP49450 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPAP49450 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPAP49450 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPAP49450 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPAP49450 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPAP49450 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPAP49450 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPAP49450 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPAP49450 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPAP49450 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CENPAP49450 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CENPAP49450 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPAP49450 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPAP49450 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPAP49450 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPAP49450 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPAP49450 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPAP49450 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPAP49450 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPAP49450 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPAP49450 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPAP49450 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPAP49450 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPAP49450 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPAP49450 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPAP49450 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPAP49450 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPAP49450 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPAP49450 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPAP49450 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPAP49450 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPAP49450 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPAP49450 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPAP49450 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPAP49450 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPAP49450 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPAP49450 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPAP49450 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPAP49450 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPAP49450 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPAP49450 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPAP49450 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPAP49450 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPAP49450 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPAP49450 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPAP49450 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPAP49450 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPAP49450 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPAP49450 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPAP49450 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPAP49450 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPAP49450 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPAP49450 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms