Protein–RNA interactions for Protein: P47211

GALR1, Galanin receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALR1P47211 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GALR1P47211 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GALR1P47211 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GALR1P47211 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GALR1P47211 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GALR1P47211 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GALR1P47211 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GALR1P47211 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GALR1P47211 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GALR1P47211 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GALR1P47211 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GALR1P47211 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GALR1P47211 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GALR1P47211 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GALR1P47211 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GALR1P47211 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GALR1P47211 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GALR1P47211 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GALR1P47211 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GALR1P47211 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GALR1P47211 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GALR1P47211 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GALR1P47211 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GALR1P47211 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GALR1P47211 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GALR1P47211 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GALR1P47211 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GALR1P47211 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GALR1P47211 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GALR1P47211 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GALR1P47211 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GALR1P47211 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GALR1P47211 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GALR1P47211 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GALR1P47211 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GALR1P47211 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GALR1P47211 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GALR1P47211 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GALR1P47211 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GALR1P47211 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GALR1P47211 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GALR1P47211 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GALR1P47211 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GALR1P47211 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GALR1P47211 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GALR1P47211 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GALR1P47211 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GALR1P47211 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GALR1P47211 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GALR1P47211 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GALR1P47211 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GALR1P47211 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GALR1P47211 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GALR1P47211 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GALR1P47211 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GALR1P47211 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GALR1P47211 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GALR1P47211 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GALR1P47211 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GALR1P47211 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GALR1P47211 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GALR1P47211 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GALR1P47211 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GALR1P47211 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GALR1P47211 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GALR1P47211 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GALR1P47211 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GALR1P47211 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GALR1P47211 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GALR1P47211 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GALR1P47211 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GALR1P47211 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GALR1P47211 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GALR1P47211 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GALR1P47211 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GALR1P47211 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GALR1P47211 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GALR1P47211 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GALR1P47211 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GALR1P47211 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GALR1P47211 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GALR1P47211 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GALR1P47211 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GALR1P47211 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GALR1P47211 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GALR1P47211 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GALR1P47211 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GALR1P47211 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GALR1P47211 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GALR1P47211 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GALR1P47211 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GALR1P47211 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GALR1P47211 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GALR1P47211 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GALR1P47211 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GALR1P47211 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GALR1P47211 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GALR1P47211 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GALR1P47211 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GALR1P47211 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms