Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MDH1P40925 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MDH1P40925 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MDH1P40925 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MDH1P40925 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MDH1P40925 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MDH1P40925 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MDH1P40925 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
MDH1P40925 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MDH1P40925 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MDH1P40925 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MDH1P40925 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MDH1P40925 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MDH1P40925 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MDH1P40925 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MDH1P40925 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MDH1P40925 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MDH1P40925 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MDH1P40925 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MDH1P40925 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MDH1P40925 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MDH1P40925 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MDH1P40925 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MDH1P40925 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MDH1P40925 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MDH1P40925 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MDH1P40925 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MDH1P40925 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MDH1P40925 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MDH1P40925 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MDH1P40925 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MDH1P40925 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MDH1P40925 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MDH1P40925 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MDH1P40925 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MDH1P40925 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MDH1P40925 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MDH1P40925 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MDH1P40925 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MDH1P40925 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MDH1P40925 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MDH1P40925 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MDH1P40925 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MDH1P40925 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MDH1P40925 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MDH1P40925 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MDH1P40925 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MDH1P40925 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MDH1P40925 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MDH1P40925 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MDH1P40925 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MDH1P40925 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MDH1P40925 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MDH1P40925 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MDH1P40925 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MDH1P40925 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MDH1P40925 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MDH1P40925 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MDH1P40925 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MDH1P40925 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MDH1P40925 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MDH1P40925 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MDH1P40925 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MDH1P40925 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MDH1P40925 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MDH1P40925 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MDH1P40925 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MDH1P40925 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MDH1P40925 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MDH1P40925 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MDH1P40925 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MDH1P40925 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MDH1P40925 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MDH1P40925 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MDH1P40925 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MDH1P40925 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MDH1P40925 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MDH1P40925 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MDH1P40925 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MDH1P40925 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MDH1P40925 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MDH1P40925 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MDH1P40925 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MDH1P40925 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MDH1P40925 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MDH1P40925 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MDH1P40925 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MDH1P40925 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MDH1P40925 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
MDH1P40925 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MDH1P40925 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MDH1P40925 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MDH1P40925 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MDH1P40925 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MDH1P40925 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MDH1P40925 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MDH1P40925 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MDH1P40925 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MDH1P40925 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MDH1P40925 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms