Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLR2IP36954 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLR2IP36954 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLR2IP36954 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLR2IP36954 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLR2IP36954 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLR2IP36954 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLR2IP36954 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLR2IP36954 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLR2IP36954 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLR2IP36954 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLR2IP36954 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLR2IP36954 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLR2IP36954 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLR2IP36954 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLR2IP36954 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR2IP36954 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms