Protein–RNA interactions for Protein: P35789

ZNF93, Zinc finger protein 93, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF93P35789 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF93P35789 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF93P35789 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF93P35789 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF93P35789 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF93P35789 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF93P35789 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF93P35789 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF93P35789 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF93P35789 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF93P35789 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF93P35789 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF93P35789 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF93P35789 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF93P35789 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF93P35789 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF93P35789 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF93P35789 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF93P35789 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF93P35789 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF93P35789 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF93P35789 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF93P35789 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF93P35789 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF93P35789 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF93P35789 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF93P35789 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF93P35789 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF93P35789 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF93P35789 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF93P35789 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF93P35789 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNF93P35789 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNF93P35789 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNF93P35789 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNF93P35789 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNF93P35789 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF93P35789 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF93P35789 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF93P35789 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF93P35789 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF93P35789 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF93P35789 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF93P35789 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF93P35789 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF93P35789 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF93P35789 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF93P35789 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF93P35789 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF93P35789 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF93P35789 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF93P35789 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF93P35789 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF93P35789 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF93P35789 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF93P35789 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF93P35789 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF93P35789 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF93P35789 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF93P35789 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF93P35789 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF93P35789 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF93P35789 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF93P35789 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF93P35789 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF93P35789 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF93P35789 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF93P35789 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF93P35789 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF93P35789 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF93P35789 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF93P35789 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF93P35789 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF93P35789 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF93P35789 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF93P35789 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF93P35789 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF93P35789 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF93P35789 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF93P35789 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF93P35789 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF93P35789 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF93P35789 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF93P35789 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF93P35789 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF93P35789 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF93P35789 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF93P35789 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF93P35789 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF93P35789 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF93P35789 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF93P35789 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF93P35789 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF93P35789 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF93P35789 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF93P35789 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF93P35789 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF93P35789 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF93P35789 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF93P35789 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155.3 ms