Protein–RNA interactions for Protein: P35367

HRH1, Histamine H1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRH1P35367 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HRH1P35367 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HRH1P35367 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HRH1P35367 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HRH1P35367 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HRH1P35367 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HRH1P35367 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HRH1P35367 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HRH1P35367 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HRH1P35367 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HRH1P35367 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HRH1P35367 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HRH1P35367 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HRH1P35367 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HRH1P35367 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HRH1P35367 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HRH1P35367 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HRH1P35367 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HRH1P35367 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HRH1P35367 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HRH1P35367 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HRH1P35367 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HRH1P35367 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HRH1P35367 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HRH1P35367 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HRH1P35367 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HRH1P35367 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HRH1P35367 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HRH1P35367 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HRH1P35367 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HRH1P35367 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HRH1P35367 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HRH1P35367 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HRH1P35367 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HRH1P35367 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HRH1P35367 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HRH1P35367 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HRH1P35367 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HRH1P35367 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HRH1P35367 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HRH1P35367 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HRH1P35367 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HRH1P35367 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HRH1P35367 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HRH1P35367 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HRH1P35367 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HRH1P35367 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HRH1P35367 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HRH1P35367 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HRH1P35367 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HRH1P35367 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HRH1P35367 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HRH1P35367 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HRH1P35367 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HRH1P35367 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HRH1P35367 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HRH1P35367 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HRH1P35367 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HRH1P35367 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HRH1P35367 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HRH1P35367 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HRH1P35367 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HRH1P35367 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HRH1P35367 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HRH1P35367 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HRH1P35367 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HRH1P35367 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HRH1P35367 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HRH1P35367 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HRH1P35367 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HRH1P35367 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HRH1P35367 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HRH1P35367 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HRH1P35367 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HRH1P35367 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HRH1P35367 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HRH1P35367 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HRH1P35367 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HRH1P35367 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HRH1P35367 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HRH1P35367 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HRH1P35367 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HRH1P35367 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HRH1P35367 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HRH1P35367 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HRH1P35367 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HRH1P35367 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HRH1P35367 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HRH1P35367 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HRH1P35367 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HRH1P35367 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HRH1P35367 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HRH1P35367 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HRH1P35367 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HRH1P35367 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HRH1P35367 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HRH1P35367 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HRH1P35367 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HRH1P35367 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HRH1P35367 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms