Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASQ1P31415 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASQ1P31415 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASQ1P31415 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CASQ1P31415 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASQ1P31415 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASQ1P31415 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CASQ1P31415 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASQ1P31415 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASQ1P31415 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASQ1P31415 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASQ1P31415 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASQ1P31415 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASQ1P31415 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASQ1P31415 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASQ1P31415 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASQ1P31415 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASQ1P31415 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASQ1P31415 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASQ1P31415 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASQ1P31415 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASQ1P31415 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASQ1P31415 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASQ1P31415 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASQ1P31415 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASQ1P31415 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASQ1P31415 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASQ1P31415 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASQ1P31415 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASQ1P31415 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASQ1P31415 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CASQ1P31415 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASQ1P31415 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASQ1P31415 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASQ1P31415 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASQ1P31415 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASQ1P31415 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASQ1P31415 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASQ1P31415 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASQ1P31415 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASQ1P31415 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASQ1P31415 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASQ1P31415 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASQ1P31415 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASQ1P31415 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASQ1P31415 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASQ1P31415 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASQ1P31415 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASQ1P31415 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASQ1P31415 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASQ1P31415 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASQ1P31415 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
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CASQ1P31415 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASQ1P31415 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASQ1P31415 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASQ1P31415 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASQ1P31415 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASQ1P31415 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASQ1P31415 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASQ1P31415 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASQ1P31415 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASQ1P31415 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CASQ1P31415 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CASQ1P31415 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
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CASQ1P31415 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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CASQ1P31415 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CASQ1P31415 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
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CASQ1P31415 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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CASQ1P31415 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CASQ1P31415 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CASQ1P31415 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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