Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXC12P31275 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXC12P31275 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXC12P31275 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXC12P31275 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXC12P31275 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXC12P31275 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXC12P31275 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXC12P31275 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXC12P31275 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXC12P31275 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXC12P31275 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXC12P31275 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms