Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HLA-FP30511 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HLA-FP30511 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HLA-FP30511 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HLA-FP30511 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HLA-FP30511 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HLA-FP30511 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HLA-FP30511 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HLA-FP30511 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HLA-FP30511 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HLA-FP30511 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HLA-FP30511 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HLA-FP30511 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HLA-FP30511 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HLA-FP30511 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HLA-FP30511 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HLA-FP30511 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HLA-FP30511 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HLA-FP30511 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HLA-FP30511 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HLA-FP30511 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
HLA-FP30511 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HLA-FP30511 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HLA-FP30511 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HLA-FP30511 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HLA-FP30511 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HLA-FP30511 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
HLA-FP30511 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HLA-FP30511 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HLA-FP30511 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HLA-FP30511 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HLA-FP30511 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HLA-FP30511 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HLA-FP30511 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HLA-FP30511 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HLA-FP30511 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HLA-FP30511 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HLA-FP30511 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HLA-FP30511 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HLA-FP30511 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HLA-FP30511 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HLA-FP30511 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HLA-FP30511 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
HLA-FP30511 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HLA-FP30511 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HLA-FP30511 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HLA-FP30511 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HLA-FP30511 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HLA-FP30511 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLA-FP30511 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLA-FP30511 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLA-FP30511 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLA-FP30511 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLA-FP30511 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLA-FP30511 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLA-FP30511 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLA-FP30511 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLA-FP30511 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLA-FP30511 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLA-FP30511 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLA-FP30511 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLA-FP30511 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLA-FP30511 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLA-FP30511 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLA-FP30511 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLA-FP30511 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
HLA-FP30511 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLA-FP30511 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
HLA-FP30511 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HLA-FP30511 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLA-FP30511 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLA-FP30511 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLA-FP30511 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLA-FP30511 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLA-FP30511 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLA-FP30511 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLA-FP30511 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLA-FP30511 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
HLA-FP30511 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLA-FP30511 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLA-FP30511 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLA-FP30511 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLA-FP30511 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLA-FP30511 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HLA-FP30511 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
HLA-FP30511 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HLA-FP30511 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HLA-FP30511 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HLA-FP30511 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HLA-FP30511 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HLA-FP30511 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HLA-FP30511 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HLA-FP30511 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HLA-FP30511 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
HLA-FP30511 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HLA-FP30511 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HLA-FP30511 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HLA-FP30511 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HLA-FP30511 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HLA-FP30511 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms