Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PEX2P28328 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PEX2P28328 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PEX2P28328 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PEX2P28328 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PEX2P28328 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PEX2P28328 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PEX2P28328 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PEX2P28328 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PEX2P28328 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PEX2P28328 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PEX2P28328 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PEX2P28328 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PEX2P28328 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PEX2P28328 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PEX2P28328 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PEX2P28328 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PEX2P28328 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PEX2P28328 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PEX2P28328 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PEX2P28328 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PEX2P28328 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PEX2P28328 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PEX2P28328 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PEX2P28328 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PEX2P28328 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PEX2P28328 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PEX2P28328 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PEX2P28328 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PEX2P28328 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PEX2P28328 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PEX2P28328 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PEX2P28328 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PEX2P28328 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PEX2P28328 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PEX2P28328 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PEX2P28328 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PEX2P28328 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PEX2P28328 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PEX2P28328 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PEX2P28328 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PEX2P28328 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PEX2P28328 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PEX2P28328 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PEX2P28328 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PEX2P28328 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PEX2P28328 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PEX2P28328 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PEX2P28328 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PEX2P28328 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PEX2P28328 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PEX2P28328 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PEX2P28328 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PEX2P28328 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PEX2P28328 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PEX2P28328 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PEX2P28328 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PEX2P28328 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PEX2P28328 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PEX2P28328 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PEX2P28328 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PEX2P28328 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PEX2P28328 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PEX2P28328 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PEX2P28328 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PEX2P28328 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PEX2P28328 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PEX2P28328 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PEX2P28328 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PEX2P28328 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PEX2P28328 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PEX2P28328 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PEX2P28328 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PEX2P28328 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PEX2P28328 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PEX2P28328 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PEX2P28328 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PEX2P28328 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PEX2P28328 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PEX2P28328 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PEX2P28328 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PEX2P28328 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PEX2P28328 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PEX2P28328 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PEX2P28328 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PEX2P28328 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PEX2P28328 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PEX2P28328 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PEX2P28328 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PEX2P28328 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PEX2P28328 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PEX2P28328 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PEX2P28328 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PEX2P28328 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PEX2P28328 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PEX2P28328 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PEX2P28328 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PEX2P28328 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PEX2P28328 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PEX2P28328 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms