Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPS6KB1P23443 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPS6KB1P23443 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPS6KB1P23443 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPS6KB1P23443 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPS6KB1P23443 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPS6KB1P23443 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPS6KB1P23443 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RPS6KB1P23443 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPS6KB1P23443 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPS6KB1P23443 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPS6KB1P23443 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPS6KB1P23443 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPS6KB1P23443 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPS6KB1P23443 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPS6KB1P23443 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPS6KB1P23443 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPS6KB1P23443 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPS6KB1P23443 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPS6KB1P23443 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RPS6KB1P23443 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPS6KB1P23443 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPS6KB1P23443 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPS6KB1P23443 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPS6KB1P23443 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPS6KB1P23443 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPS6KB1P23443 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPS6KB1P23443 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPS6KB1P23443 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPS6KB1P23443 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPS6KB1P23443 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPS6KB1P23443 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPS6KB1P23443 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPS6KB1P23443 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPS6KB1P23443 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPS6KB1P23443 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPS6KB1P23443 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPS6KB1P23443 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPS6KB1P23443 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPS6KB1P23443 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPS6KB1P23443 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPS6KB1P23443 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPS6KB1P23443 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPS6KB1P23443 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPS6KB1P23443 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPS6KB1P23443 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPS6KB1P23443 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPS6KB1P23443 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPS6KB1P23443 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPS6KB1P23443 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPS6KB1P23443 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPS6KB1P23443 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPS6KB1P23443 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPS6KB1P23443 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPS6KB1P23443 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPS6KB1P23443 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPS6KB1P23443 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPS6KB1P23443 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPS6KB1P23443 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPS6KB1P23443 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPS6KB1P23443 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPS6KB1P23443 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RPS6KB1P23443 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPS6KB1P23443 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
RPS6KB1P23443 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RPS6KB1P23443 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RPS6KB1P23443 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPS6KB1P23443 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPS6KB1P23443 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPS6KB1P23443 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPS6KB1P23443 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPS6KB1P23443 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPS6KB1P23443 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPS6KB1P23443 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPS6KB1P23443 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPS6KB1P23443 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPS6KB1P23443 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPS6KB1P23443 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPS6KB1P23443 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPS6KB1P23443 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPS6KB1P23443 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RPS6KB1P23443 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPS6KB1P23443 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPS6KB1P23443 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPS6KB1P23443 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPS6KB1P23443 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPS6KB1P23443 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPS6KB1P23443 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPS6KB1P23443 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPS6KB1P23443 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPS6KB1P23443 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPS6KB1P23443 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPS6KB1P23443 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPS6KB1P23443 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPS6KB1P23443 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPS6KB1P23443 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPS6KB1P23443 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPS6KB1P23443 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPS6KB1P23443 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RPS6KB1P23443 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms