Protein–RNA interactions for Protein: P23435

CBLN1, Cerebellin-1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBLN1P23435 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBLN1P23435 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBLN1P23435 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBLN1P23435 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBLN1P23435 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBLN1P23435 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CBLN1P23435 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBLN1P23435 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBLN1P23435 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBLN1P23435 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBLN1P23435 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBLN1P23435 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBLN1P23435 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBLN1P23435 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBLN1P23435 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBLN1P23435 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBLN1P23435 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBLN1P23435 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CBLN1P23435 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBLN1P23435 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBLN1P23435 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBLN1P23435 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBLN1P23435 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CBLN1P23435 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBLN1P23435 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBLN1P23435 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBLN1P23435 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBLN1P23435 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBLN1P23435 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBLN1P23435 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBLN1P23435 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBLN1P23435 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBLN1P23435 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBLN1P23435 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBLN1P23435 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBLN1P23435 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBLN1P23435 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBLN1P23435 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBLN1P23435 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBLN1P23435 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBLN1P23435 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBLN1P23435 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBLN1P23435 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBLN1P23435 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBLN1P23435 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBLN1P23435 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBLN1P23435 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBLN1P23435 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBLN1P23435 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBLN1P23435 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBLN1P23435 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CBLN1P23435 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBLN1P23435 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CBLN1P23435 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBLN1P23435 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBLN1P23435 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBLN1P23435 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBLN1P23435 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBLN1P23435 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBLN1P23435 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBLN1P23435 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBLN1P23435 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBLN1P23435 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBLN1P23435 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBLN1P23435 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBLN1P23435 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBLN1P23435 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CBLN1P23435 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CBLN1P23435 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CBLN1P23435 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CBLN1P23435 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CBLN1P23435 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CBLN1P23435 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBLN1P23435 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBLN1P23435 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBLN1P23435 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBLN1P23435 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBLN1P23435 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBLN1P23435 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBLN1P23435 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBLN1P23435 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBLN1P23435 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CBLN1P23435 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBLN1P23435 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBLN1P23435 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBLN1P23435 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBLN1P23435 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBLN1P23435 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBLN1P23435 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBLN1P23435 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBLN1P23435 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBLN1P23435 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBLN1P23435 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBLN1P23435 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBLN1P23435 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBLN1P23435 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBLN1P23435 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBLN1P23435 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBLN1P23435 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBLN1P23435 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms