Protein–RNA interactions for Protein: P22888

LHCGR, Lutropin-choriogonadotropic hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHCGRP22888 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LHCGRP22888 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LHCGRP22888 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LHCGRP22888 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LHCGRP22888 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LHCGRP22888 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LHCGRP22888 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LHCGRP22888 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LHCGRP22888 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LHCGRP22888 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LHCGRP22888 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LHCGRP22888 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LHCGRP22888 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LHCGRP22888 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LHCGRP22888 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LHCGRP22888 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LHCGRP22888 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LHCGRP22888 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LHCGRP22888 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LHCGRP22888 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LHCGRP22888 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
LHCGRP22888 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LHCGRP22888 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LHCGRP22888 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LHCGRP22888 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LHCGRP22888 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LHCGRP22888 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LHCGRP22888 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LHCGRP22888 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LHCGRP22888 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LHCGRP22888 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LHCGRP22888 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LHCGRP22888 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LHCGRP22888 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LHCGRP22888 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LHCGRP22888 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LHCGRP22888 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LHCGRP22888 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LHCGRP22888 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LHCGRP22888 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LHCGRP22888 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LHCGRP22888 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LHCGRP22888 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LHCGRP22888 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LHCGRP22888 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LHCGRP22888 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LHCGRP22888 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LHCGRP22888 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LHCGRP22888 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
LHCGRP22888 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LHCGRP22888 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LHCGRP22888 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LHCGRP22888 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LHCGRP22888 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LHCGRP22888 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LHCGRP22888 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LHCGRP22888 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LHCGRP22888 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LHCGRP22888 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LHCGRP22888 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LHCGRP22888 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LHCGRP22888 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LHCGRP22888 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LHCGRP22888 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LHCGRP22888 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
LHCGRP22888 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LHCGRP22888 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LHCGRP22888 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LHCGRP22888 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LHCGRP22888 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LHCGRP22888 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LHCGRP22888 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LHCGRP22888 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LHCGRP22888 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LHCGRP22888 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LHCGRP22888 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LHCGRP22888 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LHCGRP22888 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
LHCGRP22888 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LHCGRP22888 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LHCGRP22888 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LHCGRP22888 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LHCGRP22888 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LHCGRP22888 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LHCGRP22888 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LHCGRP22888 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LHCGRP22888 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LHCGRP22888 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LHCGRP22888 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LHCGRP22888 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LHCGRP22888 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LHCGRP22888 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LHCGRP22888 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LHCGRP22888 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LHCGRP22888 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LHCGRP22888 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LHCGRP22888 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LHCGRP22888 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LHCGRP22888 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LHCGRP22888 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms