Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCNA2P20248 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCNA2P20248 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCNA2P20248 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCNA2P20248 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCNA2P20248 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCNA2P20248 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCNA2P20248 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCNA2P20248 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCNA2P20248 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCNA2P20248 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCNA2P20248 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCNA2P20248 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CCNA2P20248 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCNA2P20248 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCNA2P20248 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCNA2P20248 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCNA2P20248 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCNA2P20248 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CCNA2P20248 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCNA2P20248 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCNA2P20248 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCNA2P20248 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCNA2P20248 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCNA2P20248 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCNA2P20248 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCNA2P20248 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCNA2P20248 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCNA2P20248 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCNA2P20248 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCNA2P20248 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCNA2P20248 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCNA2P20248 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCNA2P20248 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCNA2P20248 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCNA2P20248 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCNA2P20248 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCNA2P20248 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCNA2P20248 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCNA2P20248 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCNA2P20248 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCNA2P20248 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCNA2P20248 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCNA2P20248 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCNA2P20248 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCNA2P20248 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCNA2P20248 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCNA2P20248 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCNA2P20248 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCNA2P20248 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCNA2P20248 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms