Protein–RNA interactions for Protein: P17544

ATF7, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF7P17544 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATF7P17544 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATF7P17544 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATF7P17544 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF7P17544 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF7P17544 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF7P17544 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF7P17544 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF7P17544 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF7P17544 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF7P17544 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF7P17544 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF7P17544 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF7P17544 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF7P17544 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF7P17544 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF7P17544 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF7P17544 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF7P17544 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF7P17544 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF7P17544 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF7P17544 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF7P17544 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF7P17544 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF7P17544 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF7P17544 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATF7P17544 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATF7P17544 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATF7P17544 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATF7P17544 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATF7P17544 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATF7P17544 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATF7P17544 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ATF7P17544 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATF7P17544 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATF7P17544 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATF7P17544 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATF7P17544 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATF7P17544 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATF7P17544 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATF7P17544 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATF7P17544 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATF7P17544 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATF7P17544 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF7P17544 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF7P17544 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF7P17544 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF7P17544 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF7P17544 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF7P17544 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF7P17544 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF7P17544 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF7P17544 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF7P17544 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF7P17544 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF7P17544 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF7P17544 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF7P17544 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF7P17544 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF7P17544 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF7P17544 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF7P17544 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF7P17544 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF7P17544 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF7P17544 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF7P17544 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF7P17544 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF7P17544 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF7P17544 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF7P17544 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF7P17544 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF7P17544 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF7P17544 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF7P17544 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF7P17544 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF7P17544 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF7P17544 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF7P17544 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF7P17544 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF7P17544 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF7P17544 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF7P17544 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF7P17544 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF7P17544 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF7P17544 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF7P17544 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF7P17544 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF7P17544 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF7P17544 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF7P17544 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF7P17544 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF7P17544 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF7P17544 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF7P17544 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF7P17544 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF7P17544 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF7P17544 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF7P17544 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF7P17544 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF7P17544 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms