Protein–RNA interactions for Protein: P11712

CYP2C9, Cytochrome P450 2C9, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C9P11712 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CYP2C9P11712 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYP2C9P11712 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYP2C9P11712 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CYP2C9P11712 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYP2C9P11712 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYP2C9P11712 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CYP2C9P11712 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYP2C9P11712 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYP2C9P11712 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYP2C9P11712 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYP2C9P11712 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYP2C9P11712 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYP2C9P11712 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP2C9P11712 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP2C9P11712 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP2C9P11712 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP2C9P11712 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP2C9P11712 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP2C9P11712 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP2C9P11712 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP2C9P11712 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP2C9P11712 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP2C9P11712 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP2C9P11712 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP2C9P11712 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP2C9P11712 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP2C9P11712 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP2C9P11712 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP2C9P11712 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP2C9P11712 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP2C9P11712 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP2C9P11712 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP2C9P11712 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP2C9P11712 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP2C9P11712 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP2C9P11712 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP2C9P11712 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP2C9P11712 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP2C9P11712 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP2C9P11712 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP2C9P11712 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP2C9P11712 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms