Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RARBP10826 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RARBP10826 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RARBP10826 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RARBP10826 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RARBP10826 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RARBP10826 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RARBP10826 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RARBP10826 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RARBP10826 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RARBP10826 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RARBP10826 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RARBP10826 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RARBP10826 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RARBP10826 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RARBP10826 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RARBP10826 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RARBP10826 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RARBP10826 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RARBP10826 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RARBP10826 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RARBP10826 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RARBP10826 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RARBP10826 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RARBP10826 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RARBP10826 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RARBP10826 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RARBP10826 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
RARBP10826 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RARBP10826 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RARBP10826 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RARBP10826 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RARBP10826 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RARBP10826 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RARBP10826 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RARBP10826 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RARBP10826 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RARBP10826 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RARBP10826 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RARBP10826 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RARBP10826 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RARBP10826 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RARBP10826 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RARBP10826 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RARBP10826 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RARBP10826 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RARBP10826 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RARBP10826 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RARBP10826 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RARBP10826 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RARBP10826 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RARBP10826 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RARBP10826 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RARBP10826 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RARBP10826 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RARBP10826 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RARBP10826 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RARBP10826 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RARBP10826 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RARBP10826 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RARBP10826 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RARBP10826 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RARBP10826 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RARBP10826 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RARBP10826 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RARBP10826 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RARBP10826 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RARBP10826 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RARBP10826 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RARBP10826 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RARBP10826 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RARBP10826 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RARBP10826 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RARBP10826 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RARBP10826 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RARBP10826 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RARBP10826 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RARBP10826 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RARBP10826 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RARBP10826 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RARBP10826 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RARBP10826 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RARBP10826 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RARBP10826 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RARBP10826 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RARBP10826 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RARBP10826 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RARBP10826 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RARBP10826 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RARBP10826 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RARBP10826 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RARBP10826 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RARBP10826 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RARBP10826 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RARBP10826 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RARBP10826 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RARBP10826 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RARBP10826 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RARBP10826 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RARBP10826 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms