Protein–RNA interactions for Protein: P09327

VIL1, Villin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIL1P09327 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VIL1P09327 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VIL1P09327 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VIL1P09327 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VIL1P09327 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VIL1P09327 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VIL1P09327 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VIL1P09327 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VIL1P09327 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VIL1P09327 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VIL1P09327 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VIL1P09327 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VIL1P09327 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VIL1P09327 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VIL1P09327 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VIL1P09327 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VIL1P09327 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VIL1P09327 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
VIL1P09327 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VIL1P09327 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VIL1P09327 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VIL1P09327 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VIL1P09327 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VIL1P09327 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VIL1P09327 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VIL1P09327 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
VIL1P09327 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VIL1P09327 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VIL1P09327 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VIL1P09327 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VIL1P09327 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VIL1P09327 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VIL1P09327 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VIL1P09327 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VIL1P09327 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VIL1P09327 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VIL1P09327 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VIL1P09327 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VIL1P09327 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VIL1P09327 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VIL1P09327 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VIL1P09327 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VIL1P09327 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VIL1P09327 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VIL1P09327 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VIL1P09327 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VIL1P09327 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VIL1P09327 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VIL1P09327 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VIL1P09327 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VIL1P09327 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VIL1P09327 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
VIL1P09327 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VIL1P09327 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VIL1P09327 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VIL1P09327 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VIL1P09327 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
VIL1P09327 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
VIL1P09327 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
VIL1P09327 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VIL1P09327 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VIL1P09327 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VIL1P09327 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VIL1P09327 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VIL1P09327 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
VIL1P09327 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VIL1P09327 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VIL1P09327 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VIL1P09327 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VIL1P09327 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VIL1P09327 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
VIL1P09327 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VIL1P09327 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VIL1P09327 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VIL1P09327 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VIL1P09327 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VIL1P09327 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VIL1P09327 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
VIL1P09327 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
VIL1P09327 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VIL1P09327 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VIL1P09327 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VIL1P09327 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VIL1P09327 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VIL1P09327 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VIL1P09327 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VIL1P09327 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VIL1P09327 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VIL1P09327 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VIL1P09327 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VIL1P09327 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VIL1P09327 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VIL1P09327 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VIL1P09327 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VIL1P09327 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VIL1P09327 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
VIL1P09327 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VIL1P09327 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VIL1P09327 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VIL1P09327 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms