Protein–RNA interactions for Protein: O95292

VAPB, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B/C, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPBO95292 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VAPBO95292 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VAPBO95292 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VAPBO95292 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VAPBO95292 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VAPBO95292 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VAPBO95292 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VAPBO95292 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VAPBO95292 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VAPBO95292 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VAPBO95292 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VAPBO95292 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VAPBO95292 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
VAPBO95292 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VAPBO95292 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VAPBO95292 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VAPBO95292 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
VAPBO95292 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VAPBO95292 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VAPBO95292 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VAPBO95292 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VAPBO95292 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VAPBO95292 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
VAPBO95292 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VAPBO95292 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VAPBO95292 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VAPBO95292 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VAPBO95292 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VAPBO95292 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VAPBO95292 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VAPBO95292 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VAPBO95292 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VAPBO95292 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VAPBO95292 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VAPBO95292 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VAPBO95292 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VAPBO95292 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VAPBO95292 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VAPBO95292 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VAPBO95292 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VAPBO95292 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VAPBO95292 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VAPBO95292 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VAPBO95292 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VAPBO95292 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VAPBO95292 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VAPBO95292 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
VAPBO95292 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
VAPBO95292 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VAPBO95292 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VAPBO95292 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VAPBO95292 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VAPBO95292 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VAPBO95292 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VAPBO95292 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VAPBO95292 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VAPBO95292 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VAPBO95292 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VAPBO95292 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VAPBO95292 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VAPBO95292 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VAPBO95292 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VAPBO95292 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VAPBO95292 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VAPBO95292 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VAPBO95292 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VAPBO95292 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VAPBO95292 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VAPBO95292 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VAPBO95292 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VAPBO95292 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VAPBO95292 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VAPBO95292 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VAPBO95292 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
VAPBO95292 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VAPBO95292 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VAPBO95292 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
VAPBO95292 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VAPBO95292 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VAPBO95292 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VAPBO95292 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VAPBO95292 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VAPBO95292 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VAPBO95292 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VAPBO95292 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
VAPBO95292 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VAPBO95292 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VAPBO95292 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VAPBO95292 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VAPBO95292 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VAPBO95292 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VAPBO95292 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VAPBO95292 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VAPBO95292 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VAPBO95292 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VAPBO95292 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VAPBO95292 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VAPBO95292 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
VAPBO95292 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VAPBO95292 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms