Protein–RNA interactions for Protein: O75446

SAP30, Histone deacetylase complex subunit SAP30, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAP30O75446 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SAP30O75446 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SAP30O75446 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SAP30O75446 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SAP30O75446 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SAP30O75446 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAP30O75446 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAP30O75446 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAP30O75446 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAP30O75446 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAP30O75446 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAP30O75446 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAP30O75446 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAP30O75446 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAP30O75446 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAP30O75446 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAP30O75446 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAP30O75446 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAP30O75446 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAP30O75446 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAP30O75446 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAP30O75446 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAP30O75446 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SAP30O75446 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SAP30O75446 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAP30O75446 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAP30O75446 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAP30O75446 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAP30O75446 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAP30O75446 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SAP30O75446 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SAP30O75446 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SAP30O75446 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SAP30O75446 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SAP30O75446 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SAP30O75446 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SAP30O75446 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SAP30O75446 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SAP30O75446 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SAP30O75446 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SAP30O75446 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SAP30O75446 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SAP30O75446 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SAP30O75446 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SAP30O75446 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SAP30O75446 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SAP30O75446 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SAP30O75446 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SAP30O75446 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SAP30O75446 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SAP30O75446 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SAP30O75446 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SAP30O75446 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SAP30O75446 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SAP30O75446 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SAP30O75446 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SAP30O75446 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SAP30O75446 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAP30O75446 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAP30O75446 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAP30O75446 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAP30O75446 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAP30O75446 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAP30O75446 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAP30O75446 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAP30O75446 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAP30O75446 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAP30O75446 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAP30O75446 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAP30O75446 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAP30O75446 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAP30O75446 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SAP30O75446 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAP30O75446 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAP30O75446 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAP30O75446 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAP30O75446 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAP30O75446 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAP30O75446 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAP30O75446 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAP30O75446 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAP30O75446 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAP30O75446 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAP30O75446 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAP30O75446 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAP30O75446 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAP30O75446 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAP30O75446 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAP30O75446 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAP30O75446 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAP30O75446 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAP30O75446 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAP30O75446 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAP30O75446 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAP30O75446 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAP30O75446 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SAP30O75446 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SAP30O75446 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAP30O75446 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAP30O75446 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms