Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC41.14■■■■■ 4.18
ABCC9O60706 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.18
ABCC9O60706 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.18
ABCC9O60706 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC41.13■■■■■ 4.18
ABCC9O60706 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC41.13■■■■■ 4.18
ABCC9O60706 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC41.13■■■■■ 4.18
ABCC9O60706 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
ABCC9O60706 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
ABCC9O60706 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
ABCC9O60706 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
ABCC9O60706 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC41.13■■■■■ 4.17
ABCC9O60706 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC41.13■■■■■ 4.17
ABCC9O60706 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC41.13■■■■■ 4.17
ABCC9O60706 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC41.13■■■■■ 4.17
ABCC9O60706 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC41.13■■■■■ 4.17
ABCC9O60706 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
ABCC9O60706 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
ABCC9O60706 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC41.12■■■■■ 4.17
ABCC9O60706 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
ABCC9O60706 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
ABCC9O60706 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC41.12■■■■■ 4.17
ABCC9O60706 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.12■■■■■ 4.17
ABCC9O60706 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
ABCC9O60706 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
ABCC9O60706 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
ABCC9O60706 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
ABCC9O60706 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
ABCC9O60706 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC41.11■■■■■ 4.17
ABCC9O60706 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
ABCC9O60706 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
ABCC9O60706 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
ABCC9O60706 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
ABCC9O60706 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
ABCC9O60706 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC41.1■■■■■ 4.17
ABCC9O60706 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
ABCC9O60706 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
ABCC9O60706 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC41.1■■■■■ 4.17
ABCC9O60706 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC41.1■■■■■ 4.17
ABCC9O60706 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
ABCC9O60706 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
ABCC9O60706 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC41.09■■■■■ 4.17
ABCC9O60706 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC41.09■■■■■ 4.17
ABCC9O60706 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC41.09■■■■■ 4.17
ABCC9O60706 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.09■■■■■ 4.17
ABCC9O60706 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
ABCC9O60706 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
ABCC9O60706 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
ABCC9O60706 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC41.09■■■■■ 4.17
ABCC9O60706 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC41.08■■■■■ 4.17
ABCC9O60706 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC41.08■■■■■ 4.17
ABCC9O60706 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC41.08■■■■■ 4.17
ABCC9O60706 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
ABCC9O60706 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC41.08■■■■■ 4.17
ABCC9O60706 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
ABCC9O60706 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.07■■■■■ 4.17
ABCC9O60706 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
ABCC9O60706 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
ABCC9O60706 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
ABCC9O60706 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
ABCC9O60706 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC41.07■■■■■ 4.16
ABCC9O60706 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC41.07■■■■■ 4.16
ABCC9O60706 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
ABCC9O60706 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
ABCC9O60706 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
ABCC9O60706 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
ABCC9O60706 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
ABCC9O60706 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
ABCC9O60706 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC41.06■■■■■ 4.16
ABCC9O60706 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
ABCC9O60706 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC41.06■■■■■ 4.16
ABCC9O60706 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
ABCC9O60706 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
ABCC9O60706 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.05■■■■■ 4.16
ABCC9O60706 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
ABCC9O60706 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC41.04■■■■■ 4.16
ABCC9O60706 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
ABCC9O60706 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC41.04■■■■■ 4.16
ABCC9O60706 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC41.04■■■■■ 4.16
ABCC9O60706 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC41.04■■■■■ 4.16
ABCC9O60706 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC41.04■■■■■ 4.16
ABCC9O60706 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC41.04■■■■■ 4.16
ABCC9O60706 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC41.04■■■■■ 4.16
ABCC9O60706 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.04■■■■■ 4.16
ABCC9O60706 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
ABCC9O60706 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
ABCC9O60706 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.03■■■■■ 4.16
ABCC9O60706 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC41.03■■■■■ 4.16
ABCC9O60706 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC41.03■■■■■ 4.16
ABCC9O60706 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
ABCC9O60706 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC41.03■■■■■ 4.16
ABCC9O60706 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC41.03■■■■■ 4.16
ABCC9O60706 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC41.03■■■■■ 4.16
ABCC9O60706 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC41.03■■■■■ 4.16
ABCC9O60706 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC41.03■■■■■ 4.16
ABCC9O60706 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
ABCC9O60706 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC41.02■■■■■ 4.16
ABCC9O60706 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
ABCC9O60706 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC41.02■■■■■ 4.16
ABCC9O60706 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC41.02■■■■■ 4.16
ABCC9O60706 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms