Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
KIAA0556O60303 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
KIAA0556O60303 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC32.55■■■□□ 2.8
KIAA0556O60303 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC32.55■■■□□ 2.8
KIAA0556O60303 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
KIAA0556O60303 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
KIAA0556O60303 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
KIAA0556O60303 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
KIAA0556O60303 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
KIAA0556O60303 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
KIAA0556O60303 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
KIAA0556O60303 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
KIAA0556O60303 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
KIAA0556O60303 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
KIAA0556O60303 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
KIAA0556O60303 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
KIAA0556O60303 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
KIAA0556O60303 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
KIAA0556O60303 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
KIAA0556O60303 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
KIAA0556O60303 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
KIAA0556O60303 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
KIAA0556O60303 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
KIAA0556O60303 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
KIAA0556O60303 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
KIAA0556O60303 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
KIAA0556O60303 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
KIAA0556O60303 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
KIAA0556O60303 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
KIAA0556O60303 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
KIAA0556O60303 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
KIAA0556O60303 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
KIAA0556O60303 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
KIAA0556O60303 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
KIAA0556O60303 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
KIAA0556O60303 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
KIAA0556O60303 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
KIAA0556O60303 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
KIAA0556O60303 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
KIAA0556O60303 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
KIAA0556O60303 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC32.51■■■□□ 2.8
KIAA0556O60303 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
KIAA0556O60303 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
KIAA0556O60303 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
KIAA0556O60303 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
KIAA0556O60303 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
KIAA0556O60303 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
KIAA0556O60303 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
KIAA0556O60303 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
KIAA0556O60303 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC32.5■■■□□ 2.79
KIAA0556O60303 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
KIAA0556O60303 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
KIAA0556O60303 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
KIAA0556O60303 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
KIAA0556O60303 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
KIAA0556O60303 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
KIAA0556O60303 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.49■■■□□ 2.79
KIAA0556O60303 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
KIAA0556O60303 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
KIAA0556O60303 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
KIAA0556O60303 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
KIAA0556O60303 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
KIAA0556O60303 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
KIAA0556O60303 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
KIAA0556O60303 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
KIAA0556O60303 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
KIAA0556O60303 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
KIAA0556O60303 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
KIAA0556O60303 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
KIAA0556O60303 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
KIAA0556O60303 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
KIAA0556O60303 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
KIAA0556O60303 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
KIAA0556O60303 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
KIAA0556O60303 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
KIAA0556O60303 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC32.48■■■□□ 2.79
KIAA0556O60303 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
KIAA0556O60303 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
KIAA0556O60303 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
KIAA0556O60303 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
KIAA0556O60303 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
KIAA0556O60303 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
KIAA0556O60303 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
KIAA0556O60303 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC32.47■■■□□ 2.79
KIAA0556O60303 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
KIAA0556O60303 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
KIAA0556O60303 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
KIAA0556O60303 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
KIAA0556O60303 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
KIAA0556O60303 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
KIAA0556O60303 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
KIAA0556O60303 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
KIAA0556O60303 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
KIAA0556O60303 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
KIAA0556O60303 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
KIAA0556O60303 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
KIAA0556O60303 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
KIAA0556O60303 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
KIAA0556O60303 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
KIAA0556O60303 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms