Protein–RNA interactions for Protein: O43815

STRN, Striatin, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRNO43815 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRNO43815 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRNO43815 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRNO43815 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRNO43815 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRNO43815 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRNO43815 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRNO43815 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRNO43815 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRNO43815 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRNO43815 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STRNO43815 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STRNO43815 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STRNO43815 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STRNO43815 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STRNO43815 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
STRNO43815 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
STRNO43815 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
STRNO43815 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STRNO43815 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STRNO43815 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STRNO43815 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
STRNO43815 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STRNO43815 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
STRNO43815 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STRNO43815 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STRNO43815 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
STRNO43815 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
STRNO43815 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
STRNO43815 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
STRNO43815 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
STRNO43815 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
STRNO43815 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
STRNO43815 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
STRNO43815 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
STRNO43815 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
STRNO43815 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
STRNO43815 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
STRNO43815 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
STRNO43815 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
STRNO43815 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
STRNO43815 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
STRNO43815 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
STRNO43815 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
STRNO43815 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
STRNO43815 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
STRNO43815 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
STRNO43815 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
STRNO43815 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
STRNO43815 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
STRNO43815 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
STRNO43815 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
STRNO43815 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
STRNO43815 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
STRNO43815 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
STRNO43815 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
STRNO43815 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
STRNO43815 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
STRNO43815 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
STRNO43815 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
STRNO43815 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
STRNO43815 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
STRNO43815 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
STRNO43815 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
STRNO43815 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
STRNO43815 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
STRNO43815 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
STRNO43815 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
STRNO43815 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
STRNO43815 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
STRNO43815 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
STRNO43815 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
STRNO43815 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
STRNO43815 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
STRNO43815 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
STRNO43815 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
STRNO43815 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
STRNO43815 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
STRNO43815 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
STRNO43815 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
STRNO43815 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
STRNO43815 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
STRNO43815 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
STRNO43815 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
STRNO43815 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
STRNO43815 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
STRNO43815 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
STRNO43815 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
STRNO43815 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
STRNO43815 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
STRNO43815 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
STRNO43815 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
STRNO43815 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
STRNO43815 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
STRNO43815 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
STRNO43815 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
STRNO43815 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
STRNO43815 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
STRNO43815 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
STRNO43815 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.3 ms