Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRXO43186 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRXO43186 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRXO43186 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRXO43186 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRXO43186 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRXO43186 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRXO43186 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRXO43186 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRXO43186 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRXO43186 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRXO43186 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRXO43186 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CRXO43186 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRXO43186 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRXO43186 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRXO43186 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRXO43186 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRXO43186 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRXO43186 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRXO43186 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRXO43186 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRXO43186 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRXO43186 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRXO43186 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CRXO43186 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CRXO43186 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRXO43186 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRXO43186 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRXO43186 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRXO43186 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRXO43186 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRXO43186 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRXO43186 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRXO43186 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRXO43186 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRXO43186 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRXO43186 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRXO43186 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CRXO43186 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CRXO43186 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRXO43186 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRXO43186 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRXO43186 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRXO43186 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRXO43186 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRXO43186 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRXO43186 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRXO43186 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRXO43186 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRXO43186 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRXO43186 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRXO43186 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRXO43186 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRXO43186 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRXO43186 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRXO43186 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRXO43186 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRXO43186 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRXO43186 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CRXO43186 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRXO43186 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRXO43186 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRXO43186 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRXO43186 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRXO43186 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRXO43186 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRXO43186 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRXO43186 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRXO43186 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRXO43186 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRXO43186 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRXO43186 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRXO43186 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRXO43186 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRXO43186 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRXO43186 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRXO43186 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRXO43186 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRXO43186 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRXO43186 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRXO43186 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRXO43186 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRXO43186 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRXO43186 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRXO43186 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRXO43186 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRXO43186 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRXO43186 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRXO43186 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRXO43186 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRXO43186 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRXO43186 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRXO43186 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRXO43186 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRXO43186 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRXO43186 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRXO43186 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRXO43186 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRXO43186 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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