Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLOCKO15516 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLOCKO15516 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLOCKO15516 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLOCKO15516 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLOCKO15516 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLOCKO15516 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLOCKO15516 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CLOCKO15516 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLOCKO15516 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLOCKO15516 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLOCKO15516 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLOCKO15516 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLOCKO15516 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLOCKO15516 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLOCKO15516 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLOCKO15516 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLOCKO15516 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLOCKO15516 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLOCKO15516 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLOCKO15516 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLOCKO15516 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLOCKO15516 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLOCKO15516 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLOCKO15516 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLOCKO15516 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLOCKO15516 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLOCKO15516 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLOCKO15516 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLOCKO15516 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLOCKO15516 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLOCKO15516 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLOCKO15516 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLOCKO15516 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CLOCKO15516 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLOCKO15516 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLOCKO15516 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLOCKO15516 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLOCKO15516 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLOCKO15516 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLOCKO15516 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLOCKO15516 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLOCKO15516 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CLOCKO15516 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLOCKO15516 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLOCKO15516 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLOCKO15516 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLOCKO15516 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLOCKO15516 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLOCKO15516 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLOCKO15516 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLOCKO15516 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CLOCKO15516 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLOCKO15516 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLOCKO15516 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CLOCKO15516 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLOCKO15516 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLOCKO15516 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLOCKO15516 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLOCKO15516 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLOCKO15516 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLOCKO15516 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLOCKO15516 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLOCKO15516 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLOCKO15516 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLOCKO15516 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLOCKO15516 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLOCKO15516 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLOCKO15516 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLOCKO15516 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLOCKO15516 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLOCKO15516 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLOCKO15516 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLOCKO15516 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLOCKO15516 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLOCKO15516 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLOCKO15516 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLOCKO15516 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLOCKO15516 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLOCKO15516 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLOCKO15516 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLOCKO15516 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLOCKO15516 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLOCKO15516 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLOCKO15516 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLOCKO15516 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CLOCKO15516 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLOCKO15516 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLOCKO15516 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLOCKO15516 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLOCKO15516 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLOCKO15516 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLOCKO15516 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLOCKO15516 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLOCKO15516 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLOCKO15516 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLOCKO15516 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLOCKO15516 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CLOCKO15516 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLOCKO15516 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms