Protein–RNA interactions for Protein: O00443

PIK3C2A, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C2AO00443 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PIK3C2AO00443 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PIK3C2AO00443 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PIK3C2AO00443 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PIK3C2AO00443 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PIK3C2AO00443 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PIK3C2AO00443 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PIK3C2AO00443 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PIK3C2AO00443 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PIK3C2AO00443 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PIK3C2AO00443 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PIK3C2AO00443 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PIK3C2AO00443 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PIK3C2AO00443 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PIK3C2AO00443 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PIK3C2AO00443 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PIK3C2AO00443 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PIK3C2AO00443 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PIK3C2AO00443 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PIK3C2AO00443 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PIK3C2AO00443 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PIK3C2AO00443 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PIK3C2AO00443 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PIK3C2AO00443 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PIK3C2AO00443 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PIK3C2AO00443 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PIK3C2AO00443 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PIK3C2AO00443 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PIK3C2AO00443 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PIK3C2AO00443 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PIK3C2AO00443 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PIK3C2AO00443 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PIK3C2AO00443 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PIK3C2AO00443 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PIK3C2AO00443 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PIK3C2AO00443 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PIK3C2AO00443 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PIK3C2AO00443 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PIK3C2AO00443 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PIK3C2AO00443 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PIK3C2AO00443 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PIK3C2AO00443 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PIK3C2AO00443 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PIK3C2AO00443 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PIK3C2AO00443 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PIK3C2AO00443 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PIK3C2AO00443 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PIK3C2AO00443 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PIK3C2AO00443 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PIK3C2AO00443 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PIK3C2AO00443 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PIK3C2AO00443 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PIK3C2AO00443 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PIK3C2AO00443 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PIK3C2AO00443 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PIK3C2AO00443 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PIK3C2AO00443 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PIK3C2AO00443 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PIK3C2AO00443 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PIK3C2AO00443 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PIK3C2AO00443 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PIK3C2AO00443 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PIK3C2AO00443 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PIK3C2AO00443 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PIK3C2AO00443 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PIK3C2AO00443 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PIK3C2AO00443 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PIK3C2AO00443 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PIK3C2AO00443 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PIK3C2AO00443 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PIK3C2AO00443 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PIK3C2AO00443 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PIK3C2AO00443 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PIK3C2AO00443 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PIK3C2AO00443 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PIK3C2AO00443 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PIK3C2AO00443 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PIK3C2AO00443 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PIK3C2AO00443 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PIK3C2AO00443 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PIK3C2AO00443 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PIK3C2AO00443 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PIK3C2AO00443 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PIK3C2AO00443 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PIK3C2AO00443 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PIK3C2AO00443 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PIK3C2AO00443 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PIK3C2AO00443 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PIK3C2AO00443 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PIK3C2AO00443 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PIK3C2AO00443 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PIK3C2AO00443 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PIK3C2AO00443 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PIK3C2AO00443 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PIK3C2AO00443 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PIK3C2AO00443 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PIK3C2AO00443 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PIK3C2AO00443 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PIK3C2AO00443 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PIK3C2AO00443 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms