Protein–RNA interactions for Protein: O00267

SUPT5H, Transcription elongation factor SPT5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUPT5HO00267 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
SUPT5HO00267 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
SUPT5HO00267 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
SUPT5HO00267 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
SUPT5HO00267 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
SUPT5HO00267 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
SUPT5HO00267 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
SUPT5HO00267 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
SUPT5HO00267 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
SUPT5HO00267 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
SUPT5HO00267 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
SUPT5HO00267 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
SUPT5HO00267 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
SUPT5HO00267 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
SUPT5HO00267 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
SUPT5HO00267 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
SUPT5HO00267 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
SUPT5HO00267 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
SUPT5HO00267 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
SUPT5HO00267 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
SUPT5HO00267 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
SUPT5HO00267 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
SUPT5HO00267 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
SUPT5HO00267 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
SUPT5HO00267 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
SUPT5HO00267 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
SUPT5HO00267 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.44
SUPT5HO00267 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.43
SUPT5HO00267 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
SUPT5HO00267 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC36.51■■■■□ 3.43
SUPT5HO00267 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
SUPT5HO00267 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
SUPT5HO00267 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
SUPT5HO00267 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
SUPT5HO00267 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
SUPT5HO00267 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
SUPT5HO00267 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
SUPT5HO00267 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
SUPT5HO00267 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
SUPT5HO00267 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
SUPT5HO00267 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
SUPT5HO00267 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
SUPT5HO00267 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
SUPT5HO00267 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
SUPT5HO00267 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
SUPT5HO00267 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
SUPT5HO00267 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.49■■■■□ 3.43
SUPT5HO00267 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
SUPT5HO00267 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
SUPT5HO00267 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
SUPT5HO00267 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
SUPT5HO00267 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
SUPT5HO00267 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
SUPT5HO00267 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
SUPT5HO00267 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
SUPT5HO00267 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
SUPT5HO00267 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
SUPT5HO00267 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC36.48■■■■□ 3.43
SUPT5HO00267 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
SUPT5HO00267 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
SUPT5HO00267 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC36.48■■■■□ 3.43
SUPT5HO00267 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
SUPT5HO00267 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
SUPT5HO00267 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
SUPT5HO00267 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
SUPT5HO00267 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
SUPT5HO00267 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC36.47■■■■□ 3.43
SUPT5HO00267 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC36.47■■■■□ 3.43
SUPT5HO00267 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
SUPT5HO00267 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC36.47■■■■□ 3.43
SUPT5HO00267 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
SUPT5HO00267 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
SUPT5HO00267 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
SUPT5HO00267 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
SUPT5HO00267 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
SUPT5HO00267 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
SUPT5HO00267 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
SUPT5HO00267 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
SUPT5HO00267 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
SUPT5HO00267 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
SUPT5HO00267 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
SUPT5HO00267 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
SUPT5HO00267 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
SUPT5HO00267 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
SUPT5HO00267 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
SUPT5HO00267 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
SUPT5HO00267 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
SUPT5HO00267 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
SUPT5HO00267 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
SUPT5HO00267 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
SUPT5HO00267 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.45■■■■□ 3.43
SUPT5HO00267 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
SUPT5HO00267 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
SUPT5HO00267 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
SUPT5HO00267 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
SUPT5HO00267 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
SUPT5HO00267 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
SUPT5HO00267 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
SUPT5HO00267 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
SUPT5HO00267 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms