Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms